Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G166300.1
Synonym Sb08g021220
Functional annotation RING finger protein 13, putative, expressed
UniProt C5YRW5
Pfam PF13639 PF02225
Panther DB PTHR22765 PTHR22765:SF46
NCBI CDD KOG4628; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K15692; RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71980 : Protease-associated (PA) RING/U-box zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g07130.1 : RING finger protein 13, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004673 , Zm00025a030313
Brachypodium KQJ85502
Barley HORVU2Hr1G126230.4 , HORVU2Hr1G126230.5 , HORVU2Hr1G126230.6 , HORVU2Hr1G126230.1 , HORVU2Hr1G126230.2 , HORVU2Hr1G126230.3
Wheat TraesCS7D02G322500 , TraesCS7D02G322500 , TraesCS2B02G625300 , TraesCS2D02G574200 , TraesCS2D02G574200 , TraesCS7A02G325800 , TraesCS2A02G564000 , TraesCS2A02G564000 , TraesCS7B02G226400 , TraesCS7B02G226400 , TraesCS2B02G625300 , TraesCS7A02G325800 , TraesCS7B02G226400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.002G144933 - -
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20 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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