Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G396100.1
Synonym Sb01g037490
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QNM8
Pfam -
Panther DB PTHR35702 PTHR35702:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G56423 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052562 , Zm00025a002130
Brachypodium KQK22010
Barley -
Wheat TraesCS4A02G120900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G396100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G296300 expressed protein -
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8 Sobic.004G222600 expressed protein -
9 Sobic.009G059700 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
10 Sobic.010G052800 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
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12 Sobic.006G218700 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G332401 - K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
14 Sobic.003G002400 dnaJ domain containing protein, expressed K09510: DnaJ homolog subfamily B member 4
15 Sobic.002G196350 - K14011: UBXN6, UBX domain-containing protein 6
16 Sobic.006G091100 expressed protein -
17 Sobic.006G255100 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09578: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1
18 Sobic.003G023000 CID11, putative, expressed -
19 Sobic.004G183400 expressed protein -
20 Sobic.002G301300 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12193: VPS24, charged multivesicular body protein 3


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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