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Transcriptome id Sobic.001G424900.1
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Functional annotation -
UniProt C5WQ26
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cDNA sequences
Sobic.001G424900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G059400 expressed protein -
2 Sobic.007G218600 phosphoribosyl transferase, putative, expressed K00761: upp, uracil phosphoribosyltransferase
3 Sobic.003G058500 expressed protein -
4 Sobic.007G223100 adenylate kinase, putative, expressed K13800: CMPK1, UMP-CMP kinase
5 Sobic.009G166600 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.005G009100 OsFBX184 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G116700 expressed protein -
8 Sobic.001G130200 DUF1336 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G345400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K05757: actin related protein 2/3 complex, subunit 1A/1B
10 Sobic.001G114200 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
11 Sobic.010G181600 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13137: STRAP, serine-threonine kinase receptor-associated protein
12 Sobic.009G039800 expressed protein -
13 Sobic.001G141400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
14 Sobic.004G180900 PSP domain containing protein, expressed K13128: zinc finger CCHC domain-containing protein 8
15 Sobic.002G147200 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed -
16 Sobic.001G340300 tentative name(PubMedID : 31536532)@expressed protein -
17 Sobic.007G148400 cyclin-dependent kinase C-3, putative, expressed K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
18 Sobic.007G153500 metal cation transporter, putative, expressed K14713: SLC39A7, KE4, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7
19 Sobic.006G210700 potassium transporter, putative, expressed -
20 Sobic.003G381600 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX, putative, expressed K03544: clpX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX


Gene co-expression network
sample Sobic001G424900 Sobic001G424900 Sobic009G059400 Sobic009G059400 Sobic001G424900--Sobic009G059400 Sobic007G218600 Sobic007G218600 Sobic001G424900--Sobic007G218600 Sobic003G058500 Sobic003G058500 Sobic001G424900--Sobic003G058500 Sobic007G223100 Sobic007G223100 Sobic001G424900--Sobic007G223100 Sobic009G166600 Sobic009G166600 Sobic001G424900--Sobic009G166600 Sobic005G009100 Sobic005G009100 Sobic001G424900--Sobic005G009100 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic001G424900--Sobic008G116700 Sobic001G130200 Sobic001G130200 Sobic001G424900--Sobic001G130200 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic001G424900--Sobic004G345400 Sobic009G017200 Sobic009G017200 Sobic009G059400--Sobic009G017200 Sobic005G198200 Sobic005G198200 Sobic009G059400--Sobic005G198200 Sobic009G059400--Sobic007G218600 Sobic006G144000 Sobic006G144000 Sobic009G059400--Sobic006G144000 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic009G059400--Sobic003G393200 Sobic009G125000 Sobic009G125000 Sobic009G059400--Sobic009G125000 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Octagon: transcription factors


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