Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G039800.1
Synonym EMF1, Sb09g003380
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YZZ0
Pfam -
Panther DB PTHR35504
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G11530 : embryonic flower 1 (EMF1)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g12890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055379 , Zm00025a038114
Brachypodium KQK03415 , KQK03414 , KQK03413 , PNT70207 , PNT70206 , PNT70208
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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7 Sobic.004G180900 PSP domain containing protein, expressed K13128: zinc finger CCHC domain-containing protein 8
8 Sobic.001G424900 - -
9 Sobic.008G116700 expressed protein -
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13 Sobic.001G017200 protein transporter, putative, expressed K12275: translocation protein SEC62
14 Sobic.009G260650 - -
15 Sobic.003G113300 expressed protein -
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18 Sobic.009G059400 expressed protein -
19 Sobic.006G128100 lipase, putative, expressed -
20 Sobic.001G308400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G039800 Sobic009G039800 Sobic002G056900 Sobic002G056900 Sobic009G039800--Sobic002G056900 Sobic006G210700 Sobic006G210700 Sobic009G039800--Sobic006G210700 Sobic010G077500 Sobic010G077500 Sobic009G039800--Sobic010G077500 Sobic009G228000 Sobic009G228000 Sobic009G039800--Sobic009G228000 Sobic009G166600 Sobic009G166600 Sobic009G039800--Sobic009G166600 Sobic003G043000 Sobic003G043000 Sobic009G039800--Sobic003G043000 Sobic004G180900 Sobic004G180900 Sobic009G039800--Sobic004G180900 Sobic001G424900 Sobic001G424900 Sobic009G039800--Sobic001G424900 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic009G039800--Sobic008G116700 Sobic002G056900--Sobic009G039800 Sobic001G017200 Sobic001G017200 Sobic002G056900--Sobic001G017200 Sobic002G056900--Sobic004G180900 Sobic004G218300 Sobic004G218300 Sobic002G056900--Sobic004G218300 Sobic002G264600 Sobic002G264600 Sobic002G056900--Sobic002G264600 Sobic003G381600 Sobic003G381600 Sobic002G056900--Sobic003G381600 Sobic004G116600 Sobic004G116600 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Octagon: transcription factors


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