Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G446300.1
Synonym Sb01g041940
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WRQ3
Pfam -
Panther DB PTHR34356 PTHR34356:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G12530 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g12720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019283
Brachypodium KQK22737
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G004300 phosphate/phosphoenolpyruvate translocator-related protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G282200 ribosomal protein L35, putative, expressed -
3 Sobic.003G235100 HD domain containing protein 2, putative, expressed K07023: putative hydrolases of HD superfamily
4 Sobic.003G065201 - -
5 Sobic.008G136700 expressed protein -
6 Sobic.005G145201 - K06630: 14-3-3 protein epsilon
7 Sobic.009G252200 expressed protein K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
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9 Sobic.006G115100 expressed protein -
10 Sobic.002G213900 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G107100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CID11, putative, expressed -
12 Sobic.004G176200 SacI homology domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G387300 exostosin family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
15 Sobic.010G196300 CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
16 Sobic.003G089100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G413500 F-actin-capping protein subunit alpha, putative, expressed K10364: capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha
18 Sobic.006G232800 expressed protein K17785: IMMT, FCJ1, mitofilin
19 Sobic.010G027100 expressed protein -
20 Sobic.002G304700 RFT1, putative, expressed K06316: oligosaccharide translocation protein RFT1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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