Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G506750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBI0
Pfam -
Panther DB PTHR32285 PTHR32285:SF49
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01370.1 : PMR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044366 , Zm00025a033244 , Zm00025a053657
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G048030.1
Wheat TraesCS5D02G158900 , TraesCS5A02G153600 , TraesCS5B02G152100 , TraesCS5B02G152100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G192200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@key enzymes in the phenylptropanoid pathway(PubMedID : 28119720)@cytokinin-O-glucosyltransferase 3, putative, expressed -
2 Sobic.002G093700 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G124500 expansin precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G348300 expressed protein -
5 Sobic.009G157450 - -
6 Sobic.007G118800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
7 Sobic.005G066100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G425000 VQ domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G292001 - -
11 Sobic.010G234400 O-methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.005G066432 - -
13 Sobic.008G128066 - -
14 Sobic.010G003600 LTPL127 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G158500 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G140900 expressed protein -
17 Sobic.002G053700 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
18 Sobic.001G348500 expressed protein -
19 Sobic.006G019200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR4 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
20 Sobic.008G127933 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G506750 Sobic001G506750 Sobic005G192200 Sobic005G192200 Sobic001G506750--Sobic005G192200 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic001G506750--Sobic002G093700 Sobic002G124500 Sobic002G124500 Sobic001G506750--Sobic002G124500 Sobic001G348300 Sobic001G348300 Sobic001G506750--Sobic001G348300 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic001G506750--Sobic009G157450 Sobic007G118800 Sobic007G118800 Sobic001G506750--Sobic007G118800 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic001G506750--Sobic005G066100 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic001G506750--Sobic006G268500 Sobic002G425000 Sobic002G425000 Sobic001G506750--Sobic002G425000 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic005G192200--Sobic002G365550 Sobic005G192200--Sobic002G124500 Sobic002G365801 Sobic002G365801 Sobic005G192200--Sobic002G365801 Sobic003G228700 Sobic003G228700 Sobic005G192200--Sobic003G228700 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic005G192200--Sobic005G066432 Sobic004G283900 Sobic004G283900 Sobic005G192200--Sobic004G283900 Sobic005G192200--Sobic001G506750 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic005G192200--Sobic005G160700 Sobic008G172500 Sobic008G172500 Sobic005G192200--Sobic008G172500 Sobic001G487400 Sobic001G487400 Sobic002G093700--Sobic001G487400 Sobic008G128066 Sobic008G128066 Sobic002G093700--Sobic008G128066 Sobic006G019200 Sobic006G019200 Sobic002G093700--Sobic006G019200 Sobic007G144501 Sobic007G144501 Sobic002G093700--Sobic007G144501 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic002G093700--Sobic006G234900 Sobic002G115025 Sobic002G115025 Sobic002G093700--Sobic002G115025 Sobic004G045400 Sobic004G045400 Sobic002G093700--Sobic004G045400 Sobic001G256200 Sobic001G256200 Sobic002G093700--Sobic001G256200 Sobic006G078900 Sobic006G078900 Sobic002G093700--Sobic006G078900 Sobic003G053400 Sobic003G053400 Sobic002G124500--Sobic003G053400 SobicK026900 SobicK026900 Sobic002G124500--SobicK026900 Sobic001G508532 Sobic001G508532 Sobic002G124500--Sobic001G508532 Sobic002G124500--Sobic002G425000 Sobic004G348800 Sobic004G348800 Sobic002G124500--Sobic004G348800 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic002G124500--Sobic010G158500 Sobic003G053300 Sobic003G053300 Sobic002G124500--Sobic003G053300 Sobic010G212500 Sobic010G212500 Sobic002G124500--Sobic010G212500 Sobic006G202600 Sobic006G202600 Sobic002G124500--Sobic006G202600 Sobic002G053700 Sobic002G053700 Sobic001G348300--Sobic002G053700 Sobic001G176300 Sobic001G176300 Sobic001G348300--Sobic001G176300 Sobic001G348500 Sobic001G348500 Sobic001G348300--Sobic001G348500 Sobic001G039200 Sobic001G039200 Sobic001G348300--Sobic001G039200 Sobic005G063400 Sobic005G063400 Sobic001G348300--Sobic005G063400 Sobic001G348300--Sobic002G425000 Sobic010G161800 Sobic010G161800 Sobic001G348300--Sobic010G161800 Sobic001G340400 Sobic001G340400 Sobic001G348300--Sobic001G340400 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic001G348300--Sobic006G122800 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic009G157450--Sobic008G140900 Sobic009G157450--Sobic006G268500 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic009G157450--Sobic006G227750 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic009G157450--Sobic009G071000 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic009G157450--Sobic008G158332 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic009G157450--Sobic002G422300 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic006G234900 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic009G157450--Sobic002G010900 Sobic007G118800--Sobic002G093700 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic007G118800--Sobic007G065800 Sobic007G118800--Sobic006G268500 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic007G118800--Sobic003G364950 Sobic007G118800--Sobic006G234900 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic007G118800--Sobic005G108601 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic007G118800--Sobic004G292001 Sobic007G118800--Sobic001G506750 Sobic007G118800--Sobic002G115025 Sobic005G066100--Sobic005G066432 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic005G066100--Sobic004G202400 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic005G066100--Sobic005G065900 Sobic005G066100--SobicK026900 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic005G066100--Sobic007G204700 Sobic005G066100--Sobic002G425000 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic005G066100--Sobic010G148800 Sobic008G127933 Sobic008G127933 Sobic005G066100--Sobic008G127933 Sobic005G066100--Sobic010G158500 Sobic006G268500--Sobic009G071000 Sobic006G268500--Sobic008G140900 Sobic006G268500--Sobic009G157450 Sobic006G268500--Sobic006G227750 Sobic006G268500--Sobic008G158332 Sobic006G268500--Sobic002G422300 Sobic006G268500--Sobic002G010900 Sobic006G268500--Sobic006G234900 Sobic006G268500--Sobic006G026500 Sobic001G238300 Sobic001G238300 Sobic002G425000--Sobic001G238300 Sobic002G261500 Sobic002G261500 Sobic002G425000--Sobic002G261500 Sobic002G425000--Sobic008G127933 Sobic001G237900 Sobic001G237900 Sobic002G425000--Sobic001G237900 Sobic006G260200 Sobic006G260200 Sobic002G425000--Sobic006G260200 Sobic004G297900 Sobic004G297900 Sobic002G425000--Sobic004G297900 Sobic002G425000--SobicK026900 Sobic002G425000--Sobic003G053400 Sobic002G425000--Sobic006G122800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.