Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G005300.1
Synonym Sb02g000690
Functional annotation dirigent, putative, expressed
UniProt C5X765
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF66
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42510 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01660.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044862
Brachypodium PNT66222
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.001G416900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
19 Sobic.001G416800 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
20 Sobic.007G184700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G005300 Sobic002G005300 Sobic008G178901 Sobic008G178901 Sobic002G005300--Sobic008G178901 Sobic007G052600 Sobic007G052600 Sobic002G005300--Sobic007G052600 Sobic009G206800 Sobic009G206800 Sobic002G005300--Sobic009G206800 Sobic001G008400 Sobic001G008400 Sobic002G005300--Sobic001G008400 Sobic004G358700 Sobic004G358700 Sobic002G005300--Sobic004G358700 Sobic008G061000 Sobic008G061000 Sobic002G005300--Sobic008G061000 Sobic008G088860 Sobic008G088860 Sobic002G005300--Sobic008G088860 Sobic009G123000 Sobic009G123000 Sobic002G005300--Sobic009G123000 Sobic006G009900 Sobic006G009900 Sobic002G005300--Sobic006G009900 Sobic010G155500 Sobic010G155500 Sobic008G178901--Sobic010G155500 Sobic008G178901--Sobic007G052600 Sobic008G178901--Sobic002G005300 Sobic008G178901--Sobic009G206800 Sobic004G329100 Sobic004G329100 Sobic008G178901--Sobic004G329100 Sobic008G178901--Sobic008G061000 Sobic010G014200 Sobic010G014200 Sobic008G178901--Sobic010G014200 Sobic008G178901--Sobic001G008400 Sobic006G197000 Sobic006G197000 Sobic008G178901--Sobic006G197000 Sobic007G052600--Sobic008G061000 Sobic007G052600--Sobic010G155500 Sobic007G052600--Sobic008G178901 Sobic007G052600--Sobic006G197000 Sobic007G052600--Sobic009G206800 Sobic004G128600 Sobic004G128600 Sobic007G052600--Sobic004G128600 Sobic007G052600--Sobic004G329100 Sobic001G193400 Sobic001G193400 Sobic007G052600--Sobic001G193400 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic007G052600--Sobic001G200500 Sobic009G206800--Sobic007G052600 Sobic009G206800--Sobic006G009900 Sobic009G206800--Sobic002G005300 Sobic009G206800--Sobic008G178901 Sobic009G206800--Sobic006G197000 Sobic009G206800--Sobic008G061000 Sobic009G206800--Sobic001G008400 Sobic010G161300 Sobic010G161300 Sobic009G206800--Sobic010G161300 Sobic009G206800--Sobic009G123000 Sobic001G008400--Sobic008G178901 Sobic001G008400--Sobic009G206800 Sobic001G008400--Sobic002G005300 Sobic001G008400--Sobic010G014200 Sobic006G278400 Sobic006G278400 Sobic001G008400--Sobic006G278400 Sobic007G184700 Sobic007G184700 Sobic001G008400--Sobic007G184700 Sobic001G008400--Sobic007G052600 Sobic001G008400--Sobic010G161300 Sobic002G279300 Sobic002G279300 Sobic001G008400--Sobic002G279300 Sobic004G358700--Sobic008G178901 Sobic004G358700--Sobic002G005300 Sobic002G209300 Sobic002G209300 Sobic004G358700--Sobic002G209300 Sobic004G358700--Sobic007G052600 Sobic010G241500 Sobic010G241500 Sobic004G358700--Sobic010G241500 Sobic004G358700--Sobic009G206800 Sobic004G358700--Sobic010G155500 Sobic010G099400 Sobic010G099400 Sobic004G358700--Sobic010G099400 Sobic004G358700--Sobic009G123000 Sobic008G061000--Sobic001G200500 Sobic008G061000--Sobic004G329100 Sobic008G061000--Sobic004G128600 Sobic008G061000--Sobic006G197000 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic008G061000--Sobic008G133100 Sobic001G541900 Sobic001G541900 Sobic008G061000--Sobic001G541900 Sobic008G061000--Sobic001G193400 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic008G061000--Sobic007G001300 Sobic003G350100 Sobic003G350100 Sobic008G061000--Sobic003G350100 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic008G088860--Sobic003G379500 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic008G088860--Sobic009G031300 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic008G088860--Sobic005G076100 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic008G088860--Sobic006G037000 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic008G088860--Sobic001G115900 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic008G088860--Sobic008G096900 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G088860--Sobic009G082400 Sobic008G088860--Sobic004G329100 Sobic008G088860--Sobic001G541900 Sobic003G127600 Sobic003G127600 Sobic009G123000--Sobic003G127600 Sobic001G416800 Sobic001G416800 Sobic009G123000--Sobic001G416800 Sobic005G198300 Sobic005G198300 Sobic009G123000--Sobic005G198300 Sobic006G003000 Sobic006G003000 Sobic009G123000--Sobic006G003000 Sobic001G416900 Sobic001G416900 Sobic009G123000--Sobic001G416900 Sobic001G148600 Sobic001G148600 Sobic009G123000--Sobic001G148600 Sobic009G123000--Sobic008G061000 Sobic009G155500 Sobic009G155500 Sobic009G123000--Sobic009G155500 Sobic009G123000--Sobic010G161300 Sobic006G009900--Sobic009G206800 Sobic008G083300 Sobic008G083300 Sobic006G009900--Sobic008G083300 Sobic006G009900--Sobic002G005300 Sobic006G009900--Sobic008G178901 Sobic008G183500 Sobic008G183500 Sobic006G009900--Sobic008G183500 Sobic006G009900--Sobic006G003000 Sobic004G007800 Sobic004G007800 Sobic006G009900--Sobic004G007800 Sobic001G189500 Sobic001G189500 Sobic006G009900--Sobic001G189500 Sobic006G009900--Sobic007G052600
Octagon: transcription factors


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