Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G009900.1,Sobic.006G009900.2
Synonym Sb06g001000
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PJD1
Pfam -
Panther DB PTHR32054 PTHR32054:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75720 : Plant protein of unknown function (DUF827)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g02650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012227
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G016100 , TraesCS2D02G006400 , TraesCS2B02G016100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G206800 WRKY23, expressed -
2 Sobic.008G083300 expressed protein -
3 Sobic.002G005300 dirigent, putative, expressed -
4 Sobic.008G178901 - -
5 Sobic.008G183500 - -
6 Sobic.006G003000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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10 Sobic.004G147400 dirigent, putative, expressed -
11 Sobic.001G008400 brevis radix, putative, expressed -
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14 Sobic.010G161300 receptor-like kinase, putative, expressed -
15 Sobic.009G123000 expressed protein -
16 Sobic.002G279300 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G122800 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
18 Sobic.009G253300 Myb family transcription factor(PubMedID : 26320239)@Myb transcription factor, putative, expressed -
19 Sobic.002G070800 glucosyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.006G079100 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G009900 Sobic006G009900 Sobic009G206800 Sobic009G206800 Sobic006G009900--Sobic009G206800 Sobic008G083300 Sobic008G083300 Sobic006G009900--Sobic008G083300 Sobic002G005300 Sobic002G005300 Sobic006G009900--Sobic002G005300 Sobic008G178901 Sobic008G178901 Sobic006G009900--Sobic008G178901 Sobic008G183500 Sobic008G183500 Sobic006G009900--Sobic008G183500 Sobic006G003000 Sobic006G003000 Sobic006G009900--Sobic006G003000 Sobic004G007800 Sobic004G007800 Sobic006G009900--Sobic004G007800 Sobic001G189500 Sobic001G189500 Sobic006G009900--Sobic001G189500 Sobic007G052600 Sobic007G052600 Sobic006G009900--Sobic007G052600 Sobic009G206800--Sobic007G052600 Sobic009G206800--Sobic006G009900 Sobic009G206800--Sobic002G005300 Sobic009G206800--Sobic008G178901 Sobic006G197000 Sobic006G197000 Sobic009G206800--Sobic006G197000 Sobic008G061000 Sobic008G061000 Sobic009G206800--Sobic008G061000 Sobic001G008400 Sobic001G008400 Sobic009G206800--Sobic001G008400 Sobic010G161300 Sobic010G161300 Sobic009G206800--Sobic010G161300 Sobic009G123000 Sobic009G123000 Sobic009G206800--Sobic009G123000 Sobic008G083300--Sobic006G009900 Sobic008G083300--Sobic009G206800 Sobic003G300100 Sobic003G300100 Sobic008G083300--Sobic003G300100 Sobic002G279300 Sobic002G279300 Sobic008G083300--Sobic002G279300 Sobic008G083300--Sobic004G007800 Sobic008G083300--Sobic001G008400 Sobic001G451800 Sobic001G451800 Sobic008G083300--Sobic001G451800 Sobic001G253900 Sobic001G253900 Sobic008G083300--Sobic001G253900 Sobic008G083300--Sobic006G003000 Sobic002G005300--Sobic008G178901 Sobic002G005300--Sobic007G052600 Sobic002G005300--Sobic009G206800 Sobic002G005300--Sobic001G008400 Sobic004G358700 Sobic004G358700 Sobic002G005300--Sobic004G358700 Sobic002G005300--Sobic008G061000 Sobic008G088860 Sobic008G088860 Sobic002G005300--Sobic008G088860 Sobic002G005300--Sobic009G123000 Sobic002G005300--Sobic006G009900 Sobic010G155500 Sobic010G155500 Sobic008G178901--Sobic010G155500 Sobic008G178901--Sobic007G052600 Sobic008G178901--Sobic002G005300 Sobic008G178901--Sobic009G206800 Sobic004G329100 Sobic004G329100 Sobic008G178901--Sobic004G329100 Sobic008G178901--Sobic008G061000 Sobic010G014200 Sobic010G014200 Sobic008G178901--Sobic010G014200 Sobic008G178901--Sobic001G008400 Sobic008G178901--Sobic006G197000 Sobic008G183500--Sobic006G009900 Sobic008G183500--Sobic009G206800 Sobic008G183500--Sobic004G007800 Sobic008G183500--Sobic002G005300 Sobic008G183500--Sobic008G083300 Sobic005G122800 Sobic005G122800 Sobic008G183500--Sobic005G122800 Sobic003G443200 Sobic003G443200 Sobic008G183500--Sobic003G443200 Sobic003G031400 Sobic003G031400 Sobic008G183500--Sobic003G031400 Sobic002G050100 Sobic002G050100 Sobic008G183500--Sobic002G050100 Sobic006G003000--Sobic009G123000 Sobic005G198300 Sobic005G198300 Sobic006G003000--Sobic005G198300 Sobic010G194500 Sobic010G194500 Sobic006G003000--Sobic010G194500 Sobic001G005000 Sobic001G005000 Sobic006G003000--Sobic001G005000 Sobic006G018900 Sobic006G018900 Sobic006G003000--Sobic006G018900 Sobic001G148600 Sobic001G148600 Sobic006G003000--Sobic001G148600 Sobic001G239400 Sobic001G239400 Sobic006G003000--Sobic001G239400 Sobic010G014300 Sobic010G014300 Sobic006G003000--Sobic010G014300 Sobic006G003000--Sobic010G161300 Sobic004G007800--Sobic003G031400 Sobic004G007800--Sobic008G083300 Sobic004G007800--Sobic006G009900 Sobic004G007800--Sobic008G183500 Sobic007G091900 Sobic007G091900 Sobic004G007800--Sobic007G091900 Sobic008G140800 Sobic008G140800 Sobic004G007800--Sobic008G140800 Sobic004G007800--Sobic001G253900 Sobic004G007800--Sobic001G189500 Sobic002G005200 Sobic002G005200 Sobic004G007800--Sobic002G005200 Sobic001G373500 Sobic001G373500 Sobic001G189500--Sobic001G373500 Sobic002G277700 Sobic002G277700 Sobic001G189500--Sobic002G277700 Sobic005G035000 Sobic005G035000 Sobic001G189500--Sobic005G035000 Sobic001G302300 Sobic001G302300 Sobic001G189500--Sobic001G302300 Sobic003G226100 Sobic003G226100 Sobic001G189500--Sobic003G226100 Sobic004G153700 Sobic004G153700 Sobic001G189500--Sobic004G153700 Sobic009G204800 Sobic009G204800 Sobic001G189500--Sobic009G204800 Sobic001G189500--Sobic003G443200 Sobic001G189500--Sobic010G194500 Sobic007G052600--Sobic008G061000 Sobic007G052600--Sobic010G155500 Sobic007G052600--Sobic008G178901 Sobic007G052600--Sobic006G197000 Sobic007G052600--Sobic009G206800 Sobic004G128600 Sobic004G128600 Sobic007G052600--Sobic004G128600 Sobic007G052600--Sobic004G329100 Sobic001G193400 Sobic001G193400 Sobic007G052600--Sobic001G193400 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic007G052600--Sobic001G200500
Octagon: transcription factors


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