Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183500.1
Synonym Sb08g022530
Functional annotation -
UniProt C5YSV7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004804
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G009900 expressed protein -
2 Sobic.009G206800 WRKY23, expressed -
3 Sobic.004G007800 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.002G005300 dirigent, putative, expressed -
5 Sobic.008G083300 expressed protein -
6 Sobic.005G122800 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
7 Sobic.003G443200 xylem cysteine proteinase 2 precursor, putative, expressed K16290: xylem cysteine proteinase
8 Sobic.003G031400 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G050100 LTPL100 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.002G235700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G147400 dirigent, putative, expressed -
12 Sobic.003G094500 glycosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.009G253300 Myb family transcription factor(PubMedID : 26320239)@Myb transcription factor, putative, expressed -
14 Sobic.007G008400 - -
15 Sobic.008G037200 expressed protein -
16 Sobic.001G189500 FAD-binding and arabino-lactone oxidase domains containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G409000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.010G016300 BAG domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G003000 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G130100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G183500 Sobic008G183500 Sobic006G009900 Sobic006G009900 Sobic008G183500--Sobic006G009900 Sobic009G206800 Sobic009G206800 Sobic008G183500--Sobic009G206800 Sobic004G007800 Sobic004G007800 Sobic008G183500--Sobic004G007800 Sobic002G005300 Sobic002G005300 Sobic008G183500--Sobic002G005300 Sobic008G083300 Sobic008G083300 Sobic008G183500--Sobic008G083300 Sobic005G122800 Sobic005G122800 Sobic008G183500--Sobic005G122800 Sobic003G443200 Sobic003G443200 Sobic008G183500--Sobic003G443200 Sobic003G031400 Sobic003G031400 Sobic008G183500--Sobic003G031400 Sobic002G050100 Sobic002G050100 Sobic008G183500--Sobic002G050100 Sobic006G009900--Sobic009G206800 Sobic006G009900--Sobic008G083300 Sobic006G009900--Sobic002G005300 Sobic008G178901 Sobic008G178901 Sobic006G009900--Sobic008G178901 Sobic006G009900--Sobic008G183500 Sobic006G003000 Sobic006G003000 Sobic006G009900--Sobic006G003000 Sobic006G009900--Sobic004G007800 Sobic001G189500 Sobic001G189500 Sobic006G009900--Sobic001G189500 Sobic007G052600 Sobic007G052600 Sobic006G009900--Sobic007G052600 Sobic009G206800--Sobic007G052600 Sobic009G206800--Sobic006G009900 Sobic009G206800--Sobic002G005300 Sobic009G206800--Sobic008G178901 Sobic006G197000 Sobic006G197000 Sobic009G206800--Sobic006G197000 Sobic008G061000 Sobic008G061000 Sobic009G206800--Sobic008G061000 Sobic001G008400 Sobic001G008400 Sobic009G206800--Sobic001G008400 Sobic010G161300 Sobic010G161300 Sobic009G206800--Sobic010G161300 Sobic009G123000 Sobic009G123000 Sobic009G206800--Sobic009G123000 Sobic004G007800--Sobic003G031400 Sobic004G007800--Sobic008G083300 Sobic004G007800--Sobic006G009900 Sobic004G007800--Sobic008G183500 Sobic007G091900 Sobic007G091900 Sobic004G007800--Sobic007G091900 Sobic008G140800 Sobic008G140800 Sobic004G007800--Sobic008G140800 Sobic001G253900 Sobic001G253900 Sobic004G007800--Sobic001G253900 Sobic004G007800--Sobic001G189500 Sobic002G005200 Sobic002G005200 Sobic004G007800--Sobic002G005200 Sobic002G005300--Sobic008G178901 Sobic002G005300--Sobic007G052600 Sobic002G005300--Sobic009G206800 Sobic002G005300--Sobic001G008400 Sobic004G358700 Sobic004G358700 Sobic002G005300--Sobic004G358700 Sobic002G005300--Sobic008G061000 Sobic008G088860 Sobic008G088860 Sobic002G005300--Sobic008G088860 Sobic002G005300--Sobic009G123000 Sobic002G005300--Sobic006G009900 Sobic008G083300--Sobic006G009900 Sobic008G083300--Sobic009G206800 Sobic003G300100 Sobic003G300100 Sobic008G083300--Sobic003G300100 Sobic002G279300 Sobic002G279300 Sobic008G083300--Sobic002G279300 Sobic008G083300--Sobic004G007800 Sobic008G083300--Sobic001G008400 Sobic001G451800 Sobic001G451800 Sobic008G083300--Sobic001G451800 Sobic008G083300--Sobic001G253900 Sobic008G083300--Sobic006G003000 Sobic005G122800--Sobic003G443200 Sobic005G122800--Sobic002G050100 Sobic004G266700 Sobic004G266700 Sobic005G122800--Sobic004G266700 Sobic005G127200 Sobic005G127200 Sobic005G122800--Sobic005G127200 Sobic005G145100 Sobic005G145100 Sobic005G122800--Sobic005G145100 Sobic003G341500 Sobic003G341500 Sobic005G122800--Sobic003G341500 Sobic005G122800--Sobic007G091900 Sobic003G239100 Sobic003G239100 Sobic005G122800--Sobic003G239100 Sobic010G133932 Sobic010G133932 Sobic005G122800--Sobic010G133932 Sobic003G443200--Sobic005G122800 Sobic003G443200--Sobic002G050100 Sobic009G253300 Sobic009G253300 Sobic003G443200--Sobic009G253300 Sobic003G443200--Sobic003G239100 Sobic009G033400 Sobic009G033400 Sobic003G443200--Sobic009G033400 Sobic003G443200--Sobic005G145100 Sobic003G082700 Sobic003G082700 Sobic003G443200--Sobic003G082700 Sobic009G008800 Sobic009G008800 Sobic003G443200--Sobic009G008800 Sobic003G443200--Sobic007G091900 Sobic001G037400 Sobic001G037400 Sobic003G031400--Sobic001G037400 Sobic003G031400--Sobic004G007800 Sobic010G228100 Sobic010G228100 Sobic003G031400--Sobic010G228100 Sobic003G031400--Sobic001G451800 Sobic004G243800 Sobic004G243800 Sobic003G031400--Sobic004G243800 Sobic003G031400--Sobic007G091900 Sobic003G031400--Sobic008G140800 Sobic004G288500 Sobic004G288500 Sobic003G031400--Sobic004G288500 Sobic007G113900 Sobic007G113900 Sobic003G031400--Sobic007G113900 Sobic002G050100--Sobic003G341500 Sobic002G050100--Sobic004G266700 Sobic001G144800 Sobic001G144800 Sobic002G050100--Sobic001G144800 Sobic002G050100--Sobic005G122800 Sobic002G050100--Sobic009G008800 Sobic002G050100--Sobic003G443200 Sobic002G050100--Sobic005G127200 Sobic001G068500 Sobic001G068500 Sobic002G050100--Sobic001G068500 Sobic002G050100--Sobic003G239100
Octagon: transcription factors


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