Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G060700.1
Synonym
Functional annotation OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5XBS8
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF142
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g35050.1 : OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G241600 - -
2 Sobic.001G014300 OsFBDUF15 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G043000 expressed protein -
4 Sobic.002G060600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G163100 dnaJ domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G260650 - -
7 Sobic.009G228000 ubiquitin-conjugating enzyme domain containing protein, expressed K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
8 Sobic.002G386600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
9 Sobic.002G227500 protein transport protein, putative, expressed K14006: protein transport protein SEC23
10 Sobic.001G041700 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G265500 SET domain protein SDG117, putative, expressed -
12 Sobic.006G224100 expressed protein -
13 Sobic.006G225100 OsFBDUF17 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G263300 - -
15 Sobic.009G099100 rust-resistance protein Lr21, putative, expressed -
16 Sobic.009G135300 FAR1 family protein, expressed -
17 Sobic.007G155500 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G216200 expressed protein -
19 Sobic.003G256800 RNA polymerase III subunit RPC82 family protein, putative, expressed K03023: RPC3, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
20 Sobic.004G194000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G060700 Sobic002G060700 Sobic002G241600 Sobic002G241600 Sobic002G060700--Sobic002G241600 Sobic001G014300 Sobic001G014300 Sobic002G060700--Sobic001G014300 Sobic003G043000 Sobic003G043000 Sobic002G060700--Sobic003G043000 Sobic002G060600 Sobic002G060600 Sobic002G060700--Sobic002G060600 Sobic005G163100 Sobic005G163100 Sobic002G060700--Sobic005G163100 Sobic009G260650 Sobic009G260650 Sobic002G060700--Sobic009G260650 Sobic009G228000 Sobic009G228000 Sobic002G060700--Sobic009G228000 Sobic002G386600 Sobic002G386600 Sobic002G060700--Sobic002G386600 Sobic002G227500 Sobic002G227500 Sobic002G060700--Sobic002G227500 Sobic005G090300 Sobic005G090300 Sobic002G241600--Sobic005G090300 Sobic001G308400 Sobic001G308400 Sobic002G241600--Sobic001G308400 Sobic004G223300 Sobic004G223300 Sobic002G241600--Sobic004G223300 Sobic002G241600--Sobic001G014300 Sobic004G147500 Sobic004G147500 Sobic002G241600--Sobic004G147500 Sobic005G062200 Sobic005G062200 Sobic002G241600--Sobic005G062200 Sobic001G255800 Sobic001G255800 Sobic002G241600--Sobic001G255800 Sobic003G114400 Sobic003G114400 Sobic002G241600--Sobic003G114400 Sobic001G097900 Sobic001G097900 Sobic002G241600--Sobic001G097900 Sobic008G054600 Sobic008G054600 Sobic001G014300--Sobic008G054600 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic001G014300--Sobic003G312700 Sobic002G051750 Sobic002G051750 Sobic001G014300--Sobic002G051750 Sobic004G096400 Sobic004G096400 Sobic001G014300--Sobic004G096400 Sobic004G265500 Sobic004G265500 Sobic001G014300--Sobic004G265500 Sobic006G080400 Sobic006G080400 Sobic001G014300--Sobic006G080400 Sobic003G163200 Sobic003G163200 Sobic001G014300--Sobic003G163200 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic001G014300--Sobic002G154000 Sobic006G240100 Sobic006G240100 Sobic001G014300--Sobic006G240100 Sobic003G043000--Sobic004G265500 Sobic003G043000--Sobic001G308400 Sobic003G296900 Sobic003G296900 Sobic003G043000--Sobic003G296900 Sobic004G357100 Sobic004G357100 Sobic003G043000--Sobic004G357100 Sobic003G241700 Sobic003G241700 Sobic003G043000--Sobic003G241700 Sobic003G043000--Sobic009G228000 SobicK028600 SobicK028600 Sobic003G043000--SobicK028600 Sobic003G043000--Sobic003G163200 Sobic003G043000--Sobic002G227500 Sobic002G060600--Sobic009G260650 Sobic002G263300 Sobic002G263300 Sobic002G060600--Sobic002G263300 Sobic003G212900 Sobic003G212900 Sobic002G060600--Sobic003G212900 Sobic002G060600--Sobic009G228000 Sobic010G269300 Sobic010G269300 Sobic002G060600--Sobic010G269300 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic002G060600--Sobic002G063900 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic002G060600--Sobic009G000400 Sobic003G297500 Sobic003G297500 Sobic002G060600--Sobic003G297500 Sobic002G234600 Sobic002G234600 Sobic002G060600--Sobic002G234600 Sobic006G210000 Sobic006G210000 Sobic005G163100--Sobic006G210000 Sobic001G134300 Sobic001G134300 Sobic005G163100--Sobic001G134300 Sobic010G001100 Sobic010G001100 Sobic005G163100--Sobic010G001100 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic005G163100--Sobic003G133900 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic005G163100--Sobic004G155600 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic005G163100--Sobic004G246100 Sobic001G090800 Sobic001G090800 Sobic005G163100--Sobic001G090800 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic005G163100--Sobic004G355800 Sobic005G163100--Sobic001G014300 Sobic009G260650--Sobic002G063900 Sobic006G281700 Sobic006G281700 Sobic009G260650--Sobic006G281700 Sobic009G260650--Sobic003G297500 Sobic009G260650--Sobic001G308400 Sobic009G260650--Sobic004G357100 Sobic009G260650--Sobic009G228000 Sobic007G147400 Sobic007G147400 Sobic009G260650--Sobic007G147400 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic009G260650--Sobic004G122900 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic009G260650--Sobic009G129600 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic009G228000--Sobic009G107300 Sobic009G228000--Sobic003G043000 Sobic004G240400 Sobic004G240400 Sobic009G228000--Sobic004G240400 Sobic009G228000--Sobic003G241700 Sobic003G363700 Sobic003G363700 Sobic009G228000--Sobic003G363700 Sobic009G228000--Sobic002G063900 Sobic009G228000--Sobic003G297500 Sobic004G209700 Sobic004G209700 Sobic009G228000--Sobic004G209700 Sobic006G234700 Sobic006G234700 Sobic009G228000--Sobic006G234700 Sobic002G386900 Sobic002G386900 Sobic002G386600--Sobic002G386900 Sobic006G029100 Sobic006G029100 Sobic002G386600--Sobic006G029100 Sobic004G141800 Sobic004G141800 Sobic002G386600--Sobic004G141800 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic002G386600--Sobic006G265600 Sobic002G398700 Sobic002G398700 Sobic002G386600--Sobic002G398700 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic002G386600--Sobic002G160700 Sobic001G085800 Sobic001G085800 Sobic002G386600--Sobic001G085800 Sobic003G397900 Sobic003G397900 Sobic002G386600--Sobic003G397900 Sobic003G246000 Sobic003G246000 Sobic002G386600--Sobic003G246000 Sobic002G227500--Sobic001G308400 Sobic003G021600 Sobic003G021600 Sobic002G227500--Sobic003G021600 Sobic001G156900 Sobic001G156900 Sobic002G227500--Sobic001G156900 Sobic010G169900 Sobic010G169900 Sobic002G227500--Sobic010G169900 Sobic002G227500--Sobic004G265500 Sobic002G227500--Sobic003G043000 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic002G227500--Sobic003G405500 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic002G227500--Sobic003G181700 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic002G227500--Sobic010G059500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.