Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G099100.1
Synonym SBP1
Functional annotation S-RNase-binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QA85
Pfam PF13920
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19042; E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G45976 : S-ribonuclease binding protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g15730.2 : S-RNase-binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G229400 OsSCP43 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
2 Sobic.004G133100 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.009G174300 "Capable of trans-activating SbMATE promoter alleles harboring one, four, and five copies of the MITE repeats "(PubMedID : 30545913)@WRKY84, expressed -
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10 Sobic.002G168800 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
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16 Sobic.002G178200 - -
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18 Sobic.003G443700 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
19 Sobic.007G176700 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G121000 purine permease, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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