Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G131300.1,Sobic.002G131300.2
Synonym Sb02g011290
Functional annotation bacterial transferase hexapeptide domain containing protein, expressed
UniProt C5X5T9
Pfam PF00132
Panther DB PTHR22572
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21220 : Trimeric LpxA-like enzymes superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g04200.1 : bacterial transferase hexapeptide domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045910
Brachypodium KQJ91516 , KQJ91517
Barley -
Wheat TraesCS5D02G376500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G047100 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
2 Sobic.003G142700 expressed protein -
3 Sobic.001G191100 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G174900 cysteine desulfurase 1, mitochondrial precursor, putative, expressed K04487: iscS, cysteine desulfurase
5 Sobic.009G112400 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G256800 - -
7 Sobic.002G192500 ES43 protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G000150 - -
9 Sobic.008G133400 unc-93 homolog A, putative, expressed -
10 Sobic.001G144600 parafibromin, putative, expressed K15175: parafibromin
11 Sobic.004G175200 - -
12 Sobic.006G056000 OsFBL16 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.004G211400 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@splicing factor, arginine/serine-rich 7, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
14 Sobic.009G227900 expressed protein K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
15 Sobic.008G068601 - -
16 Sobic.009G096100 endoribonuclease Dicer, putative, expressed -
17 Sobic.007G043900 Brix domain containing protein, putative, expressed K14561: U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4
18 Sobic.003G018900 bromodomain containing protein, expressed K11684: bromodomain-containing factor 1
19 Sobic.004G232000 TLD family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G368800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G131300 Sobic002G131300 Sobic006G047100 Sobic006G047100 Sobic002G131300--Sobic006G047100 Sobic003G142700 Sobic003G142700 Sobic002G131300--Sobic003G142700 Sobic001G191100 Sobic001G191100 Sobic002G131300--Sobic001G191100 Sobic002G174900 Sobic002G174900 Sobic002G131300--Sobic002G174900 Sobic009G112400 Sobic009G112400 Sobic002G131300--Sobic009G112400 Sobic010G256800 Sobic010G256800 Sobic002G131300--Sobic010G256800 Sobic002G192500 Sobic002G192500 Sobic002G131300--Sobic002G192500 Sobic003G000150 Sobic003G000150 Sobic002G131300--Sobic003G000150 Sobic008G133400 Sobic008G133400 Sobic002G131300--Sobic008G133400 Sobic005G084100 Sobic005G084100 Sobic006G047100--Sobic005G084100 Sobic006G056000 Sobic006G056000 Sobic006G047100--Sobic006G056000 Sobic010G249300 Sobic010G249300 Sobic006G047100--Sobic010G249300 Sobic006G047100--Sobic002G192500 Sobic006G047100--Sobic009G112400 Sobic004G232000 Sobic004G232000 Sobic006G047100--Sobic004G232000 Sobic006G047100--Sobic002G131300 Sobic002G076000 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Octagon: transcription factors


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