Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G227900.1
Synonym Sb09g028090
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YVF9
Pfam PF11145
Panther DB PTHR33389 PTHR33389:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10581; ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21700 : Protein of unknown function (DUF2921)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g48370.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036567
Brachypodium KQK04943
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G281500 prenylcysteine oxidase 1 precursor, putative, expressed K05906: PCYOX1, prenylcysteine oxidase / farnesylcysteine lyase
2 Sobic.006G047100 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
3 Sobic.002G008500 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G209000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G485600 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
6 Sobic.001G276200 ACI13, putative, expressed -
7 Sobic.010G113000 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
8 Sobic.004G175200 - -
9 Sobic.009G213200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G085200 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6, putative, expressed K15128: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
11 Sobic.007G188600 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01880: GARS, glycyl-tRNA synthetase
12 Sobic.002G317300 CAMK_CAMK_like.33 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
13 Sobic.004G358600 cation efflux family protein, putative, expressed K14692: SLC30A5_7, ZNT5_7, MTP, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 5/7
14 Sobic.003G119400 PUR ALPHA-1, putative, expressed -
15 Sobic.002G259400 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
16 Sobic.003G368800 expressed protein -
17 Sobic.002G131300 bacterial transferase hexapeptide domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G176500 expressed protein -
19 Sobic.001G263000 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G192500 ES43 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G227900 Sobic009G227900 Sobic006G281500 Sobic006G281500 Sobic009G227900--Sobic006G281500 Sobic006G047100 Sobic006G047100 Sobic009G227900--Sobic006G047100 Sobic002G008500 Sobic002G008500 Sobic009G227900--Sobic002G008500 Sobic005G209000 Sobic005G209000 Sobic009G227900--Sobic005G209000 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic009G227900--Sobic001G485600 Sobic001G276200 Sobic001G276200 Sobic009G227900--Sobic001G276200 Sobic010G113000 Sobic010G113000 Sobic009G227900--Sobic010G113000 Sobic004G175200 Sobic004G175200 Sobic009G227900--Sobic004G175200 Sobic009G213200 Sobic009G213200 Sobic009G227900--Sobic009G213200 Sobic001G263000 Sobic001G263000 Sobic006G281500--Sobic001G263000 Sobic006G281500--Sobic009G227900 Sobic009G081500 Sobic009G081500 Sobic006G281500--Sobic009G081500 Sobic002G317300 Sobic002G317300 Sobic006G281500--Sobic002G317300 Sobic005G105500 Sobic005G105500 Sobic006G281500--Sobic005G105500 Sobic002G259400 Sobic002G259400 Sobic006G281500--Sobic002G259400 Sobic007G188600 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Octagon: transcription factors


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