Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G175200.2
Synonym Sb04g022535
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMY1
Pfam PF15938
Panther DB PTHR37192
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G36380 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g34730.1 : transposon protein, putative, Mariner sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018400
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G001400 expressed protein -
2 Sobic.009G227900 expressed protein K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
3 Sobic.004G227300 vacuolar protein-sorting protein bro1, putative, expressed K12200: PDCD6IP, ALIX, programmed cell death 6-interacting protein
4 Sobic.002G131300 bacterial transferase hexapeptide domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G250300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G045000 CAMK_CAMK_like.24 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
7 Sobic.003G053900 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
8 Sobic.003G368800 expressed protein -
9 Sobic.004G174100 expressed protein -
10 Sobic.003G004700 SOUL heme-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G261597 - K07904: Ras-related protein Rab-11A
12 Sobic.006G281500 prenylcysteine oxidase 1 precursor, putative, expressed K05906: PCYOX1, prenylcysteine oxidase / farnesylcysteine lyase
13 Sobic.002G174900 cysteine desulfurase 1, mitochondrial precursor, putative, expressed K04487: iscS, cysteine desulfurase
14 Sobic.002G259400 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
15 Sobic.002G092300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G179100 AGAP009532-PA, putative, expressed -
17 Sobic.002G055100 expressed protein -
18 Sobic.010G176500 expressed protein -
19 Sobic.009G245700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.003G142700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G175200 Sobic004G175200 Sobic008G001400 Sobic008G001400 Sobic004G175200--Sobic008G001400 Sobic009G227900 Sobic009G227900 Sobic004G175200--Sobic009G227900 Sobic004G227300 Sobic004G227300 Sobic004G175200--Sobic004G227300 Sobic002G131300 Sobic002G131300 Sobic004G175200--Sobic002G131300 Sobic004G250300 Sobic004G250300 Sobic004G175200--Sobic004G250300 Sobic001G045000 Sobic001G045000 Sobic004G175200--Sobic001G045000 Sobic003G053900 Sobic003G053900 Sobic004G175200--Sobic003G053900 Sobic003G368800 Sobic003G368800 Sobic004G175200--Sobic003G368800 Sobic004G174100 Sobic004G174100 Sobic004G175200--Sobic004G174100 Sobic002G040800 Sobic002G040800 Sobic008G001400--Sobic002G040800 Sobic010G113000 Sobic010G113000 Sobic008G001400--Sobic010G113000 Sobic005G129400 Sobic005G129400 Sobic008G001400--Sobic005G129400 Sobic008G001400--Sobic004G175200 Sobic007G120401 Sobic007G120401 Sobic008G001400--Sobic007G120401 Sobic002G273700 Sobic002G273700 Sobic008G001400--Sobic002G273700 Sobic002G174900 Sobic002G174900 Sobic008G001400--Sobic002G174900 Sobic003G206800 Sobic003G206800 Sobic008G001400--Sobic003G206800 Sobic009G082200 Sobic009G082200 Sobic008G001400--Sobic009G082200 Sobic006G281500 Sobic006G281500 Sobic009G227900--Sobic006G281500 Sobic006G047100 Sobic006G047100 Sobic009G227900--Sobic006G047100 Sobic002G008500 Sobic002G008500 Sobic009G227900--Sobic002G008500 Sobic005G209000 Sobic005G209000 Sobic009G227900--Sobic005G209000 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic009G227900--Sobic001G485600 Sobic001G276200 Sobic001G276200 Sobic009G227900--Sobic001G276200 Sobic009G227900--Sobic010G113000 Sobic009G227900--Sobic004G175200 Sobic009G213200 Sobic009G213200 Sobic009G227900--Sobic009G213200 Sobic001G427500 Sobic001G427500 Sobic004G227300--Sobic001G427500 Sobic001G261597 Sobic001G261597 Sobic004G227300--Sobic001G261597 Sobic006G171700 Sobic006G171700 Sobic004G227300--Sobic006G171700 Sobic003G359900 Sobic003G359900 Sobic004G227300--Sobic003G359900 Sobic003G299000 Sobic003G299000 Sobic004G227300--Sobic003G299000 Sobic004G214100 Sobic004G214100 Sobic004G227300--Sobic004G214100 Sobic002G259400 Sobic002G259400 Sobic004G227300--Sobic002G259400 Sobic007G062500 Sobic007G062500 Sobic004G227300--Sobic007G062500 Sobic006G119800 Sobic006G119800 Sobic004G227300--Sobic006G119800 Sobic002G131300--Sobic006G047100 Sobic003G142700 Sobic003G142700 Sobic002G131300--Sobic003G142700 Sobic001G191100 Sobic001G191100 Sobic002G131300--Sobic001G191100 Sobic002G131300--Sobic002G174900 Sobic009G112400 Sobic009G112400 Sobic002G131300--Sobic009G112400 Sobic010G256800 Sobic010G256800 Sobic002G131300--Sobic010G256800 Sobic002G192500 Sobic002G192500 Sobic002G131300--Sobic002G192500 Sobic003G000150 Sobic003G000150 Sobic002G131300--Sobic003G000150 Sobic008G133400 Sobic008G133400 Sobic002G131300--Sobic008G133400 Sobic002G092300 Sobic002G092300 Sobic004G250300--Sobic002G092300 Sobic003G405700 Sobic003G405700 Sobic004G250300--Sobic003G405700 Sobic003G250500 Sobic003G250500 Sobic004G250300--Sobic003G250500 Sobic002G180000 Sobic002G180000 Sobic004G250300--Sobic002G180000 Sobic004G301900 Sobic004G301900 Sobic004G250300--Sobic004G301900 Sobic004G250300--Sobic002G259400 Sobic009G033900 Sobic009G033900 Sobic004G250300--Sobic009G033900 Sobic010G090900 Sobic010G090900 Sobic004G250300--Sobic010G090900 Sobic002G187801 Sobic002G187801 Sobic004G250300--Sobic002G187801 Sobic001G321500 Sobic001G321500 Sobic001G045000--Sobic001G321500 Sobic005G229400 Sobic005G229400 Sobic001G045000--Sobic005G229400 Sobic001G045000--Sobic010G090900 Sobic004G173500 Sobic004G173500 Sobic001G045000--Sobic004G173500 Sobic006G277200 Sobic006G277200 Sobic001G045000--Sobic006G277200 Sobic002G119800 Sobic002G119800 Sobic001G045000--Sobic002G119800 Sobic010G009400 Sobic010G009400 Sobic001G045000--Sobic010G009400 Sobic001G045000--Sobic005G129400 Sobic001G045000--Sobic004G214100 Sobic003G053900--Sobic003G368800 Sobic004G190700 Sobic004G190700 Sobic003G053900--Sobic004G190700 Sobic009G029700 Sobic009G029700 Sobic003G053900--Sobic009G029700 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic003G053900--Sobic007G029100 Sobic001G380500 Sobic001G380500 Sobic003G053900--Sobic001G380500 Sobic003G053900--Sobic004G175200 Sobic001G418800 Sobic001G418800 Sobic003G053900--Sobic001G418800 Sobic006G058800 Sobic006G058800 Sobic003G053900--Sobic006G058800 Sobic003G053900--Sobic008G001400 Sobic001G144600 Sobic001G144600 Sobic003G368800--Sobic001G144600 Sobic003G368800--Sobic002G174900 Sobic005G025300 Sobic005G025300 Sobic003G368800--Sobic005G025300 Sobic003G368800--Sobic002G040800 Sobic004G147200 Sobic004G147200 Sobic003G368800--Sobic004G147200 Sobic002G227200 Sobic002G227200 Sobic003G368800--Sobic002G227200 Sobic003G368800--Sobic004G227300 Sobic003G368800--Sobic001G276200 Sobic001G429300 Sobic001G429300 Sobic003G368800--Sobic001G429300 Sobic001G427200 Sobic001G427200 Sobic004G174100--Sobic001G427200 Sobic006G242000 Sobic006G242000 Sobic004G174100--Sobic006G242000 Sobic002G130700 Sobic002G130700 Sobic004G174100--Sobic002G130700 Sobic005G064800 Sobic005G064800 Sobic004G174100--Sobic005G064800 Sobic001G022600 Sobic001G022600 Sobic004G174100--Sobic001G022600 Sobic002G193400 Sobic002G193400 Sobic004G174100--Sobic002G193400 Sobic008G142600 Sobic008G142600 Sobic004G174100--Sobic008G142600 Sobic004G293000 Sobic004G293000 Sobic004G174100--Sobic004G293000 Sobic004G253900 Sobic004G253900 Sobic004G174100--Sobic004G253900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.