Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G142132.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3V9
Pfam -
Panther DB PTHR33248 PTHR33248:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g41640.1 : GRF zinc finger family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G079950 - -
2 Sobic.003G306700 acetamidase, putative, expressed K01455: formamidase
3 Sobic.006G177800 Prolyl oligopeptidase family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsPOP9 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01322: prolyl oligopeptidase
4 Sobic.008G078700 - -
5 Sobic.007G125500 expressed protein -
6 Sobic.003G125900 DNA gyrase subunit B, chloroplast/mitochondrial precursor, putative, expressed K02470: DNA gyrase subunit B
7 Sobic.003G306600 acetamidase, putative, expressed K01455: formamidase
8 Sobic.001G060500 YT521-B, putative, expressed -
9 Sobic.008G037800 ACT domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G334100 zinc finger family protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G324100 diacylglycerol kinase, putative, expressed K00901: dgkA, diacylglycerol kinase (ATP)
12 Sobic.006G168650 - -
13 Sobic.005G211600 zinc knuckle family protein, expressed -
14 Sobic.006G155500 expressed protein -
15 Sobic.001G118400 expressed protein -
16 Sobic.010G178401 - -
17 Sobic.008G089500 Fe-S metabolism associated domain containing protein, expressed K03517: quinolinate synthase
18 Sobic.002G331800 PPR repeat containing protein, expressed -
19 Sobic.006G214700 APO, putative, expressed -
20 Sobic.010G125500 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin


Gene co-expression network
sample Sobic002G142132 Sobic002G142132 Sobic009G079950 Sobic009G079950 Sobic002G142132--Sobic009G079950 Sobic003G306700 Sobic003G306700 Sobic002G142132--Sobic003G306700 Sobic006G177800 Sobic006G177800 Sobic002G142132--Sobic006G177800 Sobic008G078700 Sobic008G078700 Sobic002G142132--Sobic008G078700 Sobic007G125500 Sobic007G125500 Sobic002G142132--Sobic007G125500 Sobic003G125900 Sobic003G125900 Sobic002G142132--Sobic003G125900 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic002G142132--Sobic003G306600 Sobic001G060500 Sobic001G060500 Sobic002G142132--Sobic001G060500 Sobic008G037800 Sobic008G037800 Sobic002G142132--Sobic008G037800 Sobic009G141400 Sobic009G141400 Sobic009G079950--Sobic009G141400 Sobic009G079950--Sobic003G306700 Sobic006G214700 Sobic006G214700 Sobic009G079950--Sobic006G214700 Sobic010G231100 Sobic010G231100 Sobic009G079950--Sobic010G231100 Sobic004G300000 Sobic004G300000 Sobic009G079950--Sobic004G300000 Sobic001G207200 Sobic001G207200 Sobic009G079950--Sobic001G207200 Sobic006G201100 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Sobic004G307100 Sobic008G037800--Sobic004G307100
Octagon: transcription factors


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