Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G125500.1
Synonym Sb07g020220
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKV3
Pfam -
Panther DB PTHR34464
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38060 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g31940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031031 , Zm00025a006081
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G037800 ACT domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G252500 OsProtIV1 - Putative Protease IV homologue@ Domain 2 is a SPH, expressed K04773: protease IV
3 Sobic.006G177800 Prolyl oligopeptidase family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsPOP9 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01322: prolyl oligopeptidase
4 Sobic.010G062500 protein phosphatase 2C, putative, expressed K14803: protein phosphatase PTC2/3
5 Sobic.004G165900 SOUL heme-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G072400 zeta-carotene desaturase, chloroplast/chromoplast precursor, putative, expressed K00514: ZDS, zeta-carotene desaturase
7 Sobic.003G070900 inner membrane protein, putative, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase
8 Sobic.005G199400 glutathione synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed K01920: glutathione synthase
9 Sobic.006G177900 - -
10 Sobic.004G307100 M16 domain containing zinc peptidase, putative, expressed K06972: PITRM1, PreP, presequence protease
11 Sobic.004G269800 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
12 Sobic.006G025400 - -
13 Sobic.007G166200 PPDK(PubMedID : 19549309)@NADP-malete dehydrogenase(PubMedID : 26904072)@NADP-malate dehydrogenase (NADP-MDH)(PubMedID : 16243851)@lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed K00051: malate dehydrogenase (NADP+)
14 Sobic.002G061900 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -
15 Sobic.001G118400 expressed protein -
16 Sobic.006G155500 expressed protein -
17 Sobic.006G097500 zeaxanthin epoxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K09838: ZEP, zeaxanthin epoxidase
18 Sobic.003G125900 DNA gyrase subunit B, chloroplast/mitochondrial precursor, putative, expressed K02470: DNA gyrase subunit B
19 Sobic.003G306600 acetamidase, putative, expressed K01455: formamidase
20 Sobic.002G085100 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G125500 Sobic007G125500 Sobic008G037800 Sobic008G037800 Sobic007G125500--Sobic008G037800 Sobic004G252500 Sobic004G252500 Sobic007G125500--Sobic004G252500 Sobic006G177800 Sobic006G177800 Sobic007G125500--Sobic006G177800 Sobic010G062500 Sobic010G062500 Sobic007G125500--Sobic010G062500 Sobic004G165900 Sobic004G165900 Sobic007G125500--Sobic004G165900 Sobic002G072400 Sobic002G072400 Sobic007G125500--Sobic002G072400 Sobic003G070900 Sobic003G070900 Sobic007G125500--Sobic003G070900 Sobic005G199400 Sobic005G199400 Sobic007G125500--Sobic005G199400 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic007G125500--Sobic006G177900 Sobic008G037800--Sobic002G072400 Sobic008G037800--Sobic004G252500 Sobic008G037800--Sobic004G165900 Sobic006G155500 Sobic006G155500 Sobic008G037800--Sobic006G155500 Sobic008G037800--Sobic010G062500 Sobic004G300100 Sobic004G300100 Sobic008G037800--Sobic004G300100 Sobic004G324100 Sobic004G324100 Sobic008G037800--Sobic004G324100 Sobic003G108900 Sobic003G108900 Sobic008G037800--Sobic003G108900 Sobic004G307100 Sobic004G307100 Sobic008G037800--Sobic004G307100 Sobic004G252500--Sobic004G165900 Sobic004G252500--Sobic003G108900 Sobic001G118400 Sobic001G118400 Sobic004G252500--Sobic001G118400 Sobic004G252500--Sobic004G300100 Sobic010G231500 Sobic010G231500 Sobic004G252500--Sobic010G231500 Sobic006G025400 Sobic006G025400 Sobic004G252500--Sobic006G025400 Sobic004G252500--Sobic003G070900 Sobic009G004100 Sobic009G004100 Sobic004G252500--Sobic009G004100 Sobic003G125900 Sobic003G125900 Sobic004G252500--Sobic003G125900 Sobic006G177800--Sobic007G125500 Sobic003G306700 Sobic003G306700 Sobic006G177800--Sobic003G306700 Sobic010G240500 Sobic010G240500 Sobic006G177800--Sobic010G240500 Sobic002G083200 Sobic002G083200 Sobic006G177800--Sobic002G083200 Sobic008G089500 Sobic008G089500 Sobic006G177800--Sobic008G089500 Sobic008G119300 Sobic008G119300 Sobic006G177800--Sobic008G119300 Sobic009G073100 Sobic009G073100 Sobic006G177800--Sobic009G073100 Sobic006G111600 Sobic006G111600 Sobic006G177800--Sobic006G111600 Sobic006G177800--Sobic006G155500 Sobic004G154800 Sobic004G154800 Sobic010G062500--Sobic004G154800 Sobic010G062500--Sobic004G252500 Sobic010G062500--Sobic008G037800 Sobic010G062500--Sobic004G165900 Sobic002G230600 Sobic002G230600 Sobic010G062500--Sobic002G230600 Sobic010G062500--Sobic006G025400 Sobic010G207100 Sobic010G207100 Sobic010G062500--Sobic010G207100 Sobic010G062500--Sobic004G300100 Sobic004G124400 Sobic004G124400 Sobic010G062500--Sobic004G124400 Sobic004G165900--Sobic004G252500 Sobic004G165900--Sobic003G108900 Sobic004G165900--Sobic010G231500 Sobic006G097500 Sobic006G097500 Sobic004G165900--Sobic006G097500 Sobic004G165900--Sobic001G118400 Sobic001G368600 Sobic001G368600 Sobic004G165900--Sobic001G368600 Sobic004G165900--Sobic009G004100 Sobic004G165900--Sobic006G025400 Sobic002G061900 Sobic002G061900 Sobic004G165900--Sobic002G061900 Sobic004G207400 Sobic004G207400 Sobic002G072400--Sobic004G207400 Sobic002G349100 Sobic002G349100 Sobic002G072400--Sobic002G349100 Sobic004G317700 Sobic004G317700 Sobic002G072400--Sobic004G317700 Sobic004G238200 Sobic004G238200 Sobic002G072400--Sobic004G238200 Sobic002G129400 Sobic002G129400 Sobic002G072400--Sobic002G129400 Sobic002G072400--Sobic004G307100 Sobic004G281900 Sobic004G281900 Sobic002G072400--Sobic004G281900 Sobic007G166200 Sobic007G166200 Sobic002G072400--Sobic007G166200 Sobic002G081400 Sobic002G081400 Sobic002G072400--Sobic002G081400 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic003G070900--Sobic002G133900 Sobic003G287900 Sobic003G287900 Sobic003G070900--Sobic003G287900 Sobic009G170200 Sobic009G170200 Sobic003G070900--Sobic009G170200 Sobic003G094350 Sobic003G094350 Sobic003G070900--Sobic003G094350 Sobic003G070900--Sobic001G118400 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic003G070900--Sobic001G500600 Sobic004G353100 Sobic004G353100 Sobic003G070900--Sobic004G353100 Sobic008G074000 Sobic008G074000 Sobic003G070900--Sobic008G074000 Sobic008G006100 Sobic008G006100 Sobic003G070900--Sobic008G006100 Sobic001G136800 Sobic001G136800 Sobic005G199400--Sobic001G136800 Sobic005G199400--Sobic002G072400 Sobic002G131500 Sobic002G131500 Sobic005G199400--Sobic002G131500 Sobic005G199400--Sobic004G238200 Sobic003G264800 Sobic003G264800 Sobic005G199400--Sobic003G264800 Sobic005G084800 Sobic005G084800 Sobic005G199400--Sobic005G084800 Sobic001G333500 Sobic001G333500 Sobic005G199400--Sobic001G333500 Sobic003G186900 Sobic003G186900 Sobic005G199400--Sobic003G186900 Sobic005G199400--Sobic002G349100 Sobic001G250000 Sobic001G250000 Sobic006G177900--Sobic001G250000 Sobic002G044700 Sobic002G044700 Sobic006G177900--Sobic002G044700 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic006G177900--Sobic002G077400 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic006G177900--Sobic005G093800 Sobic006G025600 Sobic006G025600 Sobic006G177900--Sobic006G025600 Sobic006G177900--Sobic004G252500 Sobic006G276100 Sobic006G276100 Sobic006G177900--Sobic006G276100 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic006G177900--Sobic003G190100 Sobic006G177900--Sobic004G165900
Octagon: transcription factors


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