Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G383050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7I1
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074:SF6 PTHR33074
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G229500 expressed protein -
2 Sobic.009G205500 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G158732 - -
4 Sobic.004G156000 dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
5 Sobic.007G148500 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G062433 - -
7 Sobic.009G032000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
8 Sobic.005G013400 WRKY52, expressed -
9 Sobic.009G201400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
10 Sobic.004G308900 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G021800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G122800 expressed protein -
13 Sobic.004G246600 expressed protein -
14 Sobic.005G013500 WRKY52, expressed -
15 Sobic.004G280000 Hydroxyjasmonate sulfotransferase (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G052500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@6-phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
17 Sobic.002G242900 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G431500 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
19 Sobic.002G358300 expressed protein -
20 Sobic.004G191400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G383050 Sobic002G383050 Sobic010G229500 Sobic010G229500 Sobic002G383050--Sobic010G229500 Sobic009G205500 Sobic009G205500 Sobic002G383050--Sobic009G205500 Sobic008G158732 Sobic008G158732 Sobic002G383050--Sobic008G158732 Sobic004G156000 Sobic004G156000 Sobic002G383050--Sobic004G156000 Sobic007G148500 Sobic007G148500 Sobic002G383050--Sobic007G148500 Sobic006G062433 Sobic006G062433 Sobic002G383050--Sobic006G062433 Sobic009G032000 Sobic009G032000 Sobic002G383050--Sobic009G032000 Sobic005G013400 Sobic005G013400 Sobic002G383050--Sobic005G013400 Sobic009G201400 Sobic009G201400 Sobic002G383050--Sobic009G201400 Sobic007G122800 Sobic007G122800 Sobic010G229500--Sobic007G122800 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic010G229500--Sobic006G007900 Sobic004G064500 Sobic004G064500 Sobic010G229500--Sobic004G064500 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic010G229500--Sobic001G259400 Sobic002G358300 Sobic002G358300 Sobic010G229500--Sobic002G358300 Sobic010G229500--Sobic008G158732 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic010G229500--Sobic003G268600 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic010G229500--Sobic005G086600 Sobic010G229500--Sobic009G032000 Sobic003G427800 Sobic003G427800 Sobic009G205500--Sobic003G427800 Sobic009G205500--Sobic008G158732 Sobic009G183900 Sobic009G183900 Sobic009G205500--Sobic009G183900 Sobic002G184300 Sobic002G184300 Sobic009G205500--Sobic002G184300 Sobic004G229400 Sobic004G229400 Sobic009G205500--Sobic004G229400 Sobic005G013500 Sobic005G013500 Sobic009G205500--Sobic005G013500 Sobic004G229500 Sobic004G229500 Sobic009G205500--Sobic004G229500 Sobic002G351300 Sobic002G351300 Sobic009G205500--Sobic002G351300 Sobic009G205500--Sobic009G032000 Sobic008G158732--Sobic009G205500 Sobic008G158732--Sobic003G427800 Sobic008G158732--Sobic004G156000 Sobic008G158732--Sobic004G229400 Sobic008G158666 Sobic008G158666 Sobic008G158732--Sobic008G158666 Sobic001G195200 Sobic001G195200 Sobic008G158732--Sobic001G195200 Sobic007G017500 Sobic007G017500 Sobic008G158732--Sobic007G017500 Sobic010G064000 Sobic010G064000 Sobic008G158732--Sobic010G064000 Sobic004G292900 Sobic004G292900 Sobic008G158732--Sobic004G292900 Sobic008G187001 Sobic008G187001 Sobic004G156000--Sobic008G187001 Sobic002G388900 Sobic002G388900 Sobic004G156000--Sobic002G388900 Sobic004G156000--Sobic008G158732 Sobic007G036900 Sobic007G036900 Sobic004G156000--Sobic007G036900 Sobic001G256700 Sobic001G256700 Sobic004G156000--Sobic001G256700 Sobic004G156000--Sobic009G183900 Sobic004G156000--Sobic001G195200 Sobic004G108200 Sobic004G108200 Sobic004G156000--Sobic004G108200 Sobic004G156000--Sobic007G017500 Sobic004G246600 Sobic004G246600 Sobic007G148500--Sobic004G246600 Sobic001G311900 Sobic001G311900 Sobic007G148500--Sobic001G311900 Sobic001G143100 Sobic001G143100 Sobic007G148500--Sobic001G143100 Sobic007G148500--Sobic004G229500 Sobic007G148500--Sobic005G013500 Sobic007G148500--Sobic009G205500 Sobic007G148500--Sobic007G122800 Sobic002G269100 Sobic002G269100 Sobic007G148500--Sobic002G269100 Sobic007G148500--Sobic002G184300 Sobic006G062433--Sobic002G383050 Sobic006G062433--Sobic010G229500 Sobic002G012400 Sobic002G012400 Sobic006G062433--Sobic002G012400 Sobic003G414900 Sobic003G414900 Sobic006G062433--Sobic003G414900 Sobic003G265150 Sobic003G265150 Sobic006G062433--Sobic003G265150 Sobic006G062433--Sobic008G158732 Sobic001G052500 Sobic001G052500 Sobic006G062433--Sobic001G052500 Sobic002G348500 Sobic002G348500 Sobic006G062433--Sobic002G348500 Sobic005G002700 Sobic005G002700 Sobic006G062433--Sobic005G002700 Sobic009G032000--Sobic001G256700 Sobic009G032000--Sobic002G388900 Sobic004G219800 Sobic004G219800 Sobic009G032000--Sobic004G219800 Sobic009G032000--Sobic002G358300 Sobic004G308900 Sobic004G308900 Sobic009G032000--Sobic004G308900 Sobic009G032000--Sobic004G246600 Sobic001G330100 Sobic001G330100 Sobic009G032000--Sobic001G330100 Sobic009G032000--Sobic005G013500 Sobic002G395300 Sobic002G395300 Sobic009G032000--Sobic002G395300 Sobic005G013400--Sobic005G013500 Sobic001G206600 Sobic001G206600 Sobic005G013400--Sobic001G206600 Sobic005G013400--Sobic004G246600 Sobic005G013400--Sobic007G148500 Sobic005G013400--Sobic004G229500 Sobic003G370600 Sobic003G370600 Sobic005G013400--Sobic003G370600 Sobic009G123733 Sobic009G123733 Sobic005G013400--Sobic009G123733 Sobic005G013400--Sobic001G143100 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic005G013400--Sobic003G060100 Sobic009G201400--Sobic009G205500 Sobic009G201400--Sobic005G013400 Sobic009G201400--Sobic004G229400 Sobic009G201400--Sobic007G148500 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic009G201400--Sobic005G180500 Sobic009G201400--Sobic005G013500 Sobic009G201400--Sobic009G183900 Sobic001G434800 Sobic001G434800 Sobic009G201400--Sobic001G434800 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic009G201400--Sobic006G277500
Octagon: transcription factors


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