Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G399400.1
Synonym Sb02g041410, TBL10
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X433
Pfam PF13839 PF14416
Panther DB PTHR32285:SF29 PTHR32285
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06080 : Plant protein of unknown function (DUF828)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ91865
Barley -
Wheat TraesCS2B02G158400 , TraesCS2B02G158400 , TraesCS7A02G533500 , TraesCS7B02G450700 , TraesCS7D02G520900 , TraesCS2A02G134800 , TraesCS2A02G134800 , TraesCS2D02G137000 , TraesCS2D02G137000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G043250 - -
2 Sobic.005G074300 - -
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7 Sobic.002G113200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
8 Sobic.002G305200 expressed protein -
9 Sobic.008G071300 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
10 Sobic.003G212000 OsCML12 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
11 Sobic.008G098164 - -
12 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
13 Sobic.005G039900 expressed protein -
14 Sobic.001G227000 zinc finger family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G014850 - -
16 Sobic.007G138100 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G158050 - -
18 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
20 Sobic.004G088900 syntaxin-related protein, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3


Gene co-expression network
sample Sobic002G399400 Sobic002G399400 Sobic010G043250 Sobic010G043250 Sobic002G399400--Sobic010G043250 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic002G399400--Sobic005G074300 Sobic003G133100 Sobic003G133100 Sobic002G399400--Sobic003G133100 Sobic003G270900 Sobic003G270900 Sobic002G399400--Sobic003G270900 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic002G399400--Sobic002G096700 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic002G399400--Sobic008G050900 Sobic002G113200 Sobic002G113200 Sobic002G399400--Sobic002G113200 Sobic002G305200 Sobic002G305200 Sobic002G399400--Sobic002G305200 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic002G399400--Sobic008G071300 Sobic010G043250--Sobic002G113200 Sobic010G043250--Sobic003G133100 Sobic003G212000 Sobic003G212000 Sobic010G043250--Sobic003G212000 Sobic005G039900 Sobic005G039900 Sobic010G043250--Sobic005G039900 Sobic003G234500 Sobic003G234500 Sobic010G043250--Sobic003G234500 Sobic007G138100 Sobic007G138100 Sobic010G043250--Sobic007G138100 Sobic003G137600 Sobic003G137600 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Octagon: transcription factors


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