Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G039900.1
Synonym Sb05g003320
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PQ29
Pfam -
Panther DB PTHR35361 PTHR35361:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92213
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G133100 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
2 Sobic.010G043250 - -
3 Sobic.003G137600 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -
4 Sobic.002G399400 expressed protein -
5 Sobic.003G212000 OsCML12 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
6 Sobic.008G071300 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
7 Sobic.009G189700 - -
8 Sobic.005G074300 - -
9 Sobic.003G234500 CA(PubMedID : 19549309)@carbonic anhydrase(PubMedID : 26904072)@-(PubMedID : 26976818)@carbonic anhydrase, chloroplast precursor, putative, expressed K01673: cynT, carbonic anhydrase
10 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
11 Sobic.007G138100 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G173700 SLL1 protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G305200 expressed protein -
14 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G066100 conserved hypothetical protein -
16 Sobic.002G113200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.008G050900 expressed protein -
18 Sobic.006G120900 dehydrogenase, putative, expressed K00030: isocitrate dehydrogenase (NAD+)
19 Sobic.004G247500 "HD-zip transcription factor, ortholog of sihdz02 of foxtail millet (Setaria italica L.)"(PubMedID : 29862293)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
20 Sobic.003G023732 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G039900 Sobic005G039900 Sobic003G133100 Sobic003G133100 Sobic005G039900--Sobic003G133100 Sobic010G043250 Sobic010G043250 Sobic005G039900--Sobic010G043250 Sobic003G137600 Sobic003G137600 Sobic005G039900--Sobic003G137600 Sobic002G399400 Sobic002G399400 Sobic005G039900--Sobic002G399400 Sobic003G212000 Sobic003G212000 Sobic005G039900--Sobic003G212000 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic005G039900--Sobic008G071300 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic005G039900--Sobic009G189700 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic005G039900--Sobic005G074300 Sobic003G234500 Sobic003G234500 Sobic005G039900--Sobic003G234500 Sobic003G133100--Sobic005G039900 Sobic003G133100--Sobic010G043250 Sobic003G133100--Sobic002G399400 Sobic003G133100--Sobic003G137600 Sobic001G365700 Sobic001G365700 Sobic003G133100--Sobic001G365700 Sobic003G240300 Sobic003G240300 Sobic003G133100--Sobic003G240300 Sobic004G173700 Sobic004G173700 Sobic003G133100--Sobic004G173700 Sobic002G113200 Sobic002G113200 Sobic003G133100--Sobic002G113200 Sobic002G305200 Sobic002G305200 Sobic003G133100--Sobic002G305200 Sobic010G043250--Sobic002G113200 Sobic010G043250--Sobic003G133100 Sobic010G043250--Sobic003G212000 Sobic010G043250--Sobic005G039900 Sobic010G043250--Sobic003G234500 Sobic007G138100 Sobic007G138100 Sobic010G043250--Sobic007G138100 Sobic010G043250--Sobic003G137600 Sobic010G043250--Sobic008G071300 Sobic004G127000 Sobic004G127000 Sobic010G043250--Sobic004G127000 Sobic003G137600--Sobic004G173700 Sobic003G137600--Sobic003G212000 Sobic003G137600--Sobic003G234500 Sobic006G120900 Sobic006G120900 Sobic003G137600--Sobic006G120900 Sobic003G137600--Sobic002G113200 Sobic003G137600--Sobic001G365700 Sobic007G212100 Sobic007G212100 Sobic003G137600--Sobic007G212100 Sobic003G284100 Sobic003G284100 Sobic003G137600--Sobic003G284100 Sobic003G137600--Sobic009G189700 Sobic002G399400--Sobic010G043250 Sobic002G399400--Sobic005G074300 Sobic002G399400--Sobic003G133100 Sobic003G270900 Sobic003G270900 Sobic002G399400--Sobic003G270900 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic002G399400--Sobic002G096700 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic002G399400--Sobic008G050900 Sobic002G399400--Sobic002G113200 Sobic002G399400--Sobic002G305200 Sobic002G399400--Sobic008G071300 Sobic003G212000--Sobic003G234500 Sobic003G212000--Sobic008G071300 Sobic003G212000--Sobic002G113200 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic003G212000--Sobic006G267100 Sobic003G212000--Sobic009G189700 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic003G212000--Sobic005G144000 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic003G212000--Sobic001G503600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic003G212000--Sobic002G389600 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic003G212000--Sobic002G170100 Sobic008G071300--Sobic006G267100 Sobic008G071300--Sobic002G170100 Sobic003G114600 Sobic003G114600 Sobic008G071300--Sobic003G114600 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic008G071300--Sobic002G283200 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic008G071300--Sobic003G290500 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic008G071300--Sobic001G039100 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic008G071300--Sobic002G340600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic008G071300--Sobic006G105100 Sobic008G071300--Sobic001G503600 Sobic009G189700--Sobic005G144000 Sobic009G189700--Sobic002G170100 Sobic009G189700--Sobic001G503600 Sobic009G189700--Sobic008G071300 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic009G189700--Sobic006G272400 Sobic009G189700--Sobic001G039100 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic009G189700--Sobic009G242200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic003G441000 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic009G189700--Sobic005G042900 Sobic005G074300--Sobic008G050900 Sobic005G074300--Sobic001G039100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic005G074300--Sobic010G129450 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic005G074300--Sobic002G381500 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G074300--Sobic003G133201 Sobic004G217100 Sobic004G217100 Sobic005G074300--Sobic004G217100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic005G074300--Sobic001G414650 Sobic002G382300 Sobic002G382300 Sobic005G074300--Sobic002G382300 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic005G074300--Sobic006G224400 Sobic003G234500--Sobic003G212000 Sobic003G234500--Sobic008G071300 Sobic003G234500--Sobic006G267100 Sobic003G234500--Sobic005G144000 Sobic003G234500--Sobic002G170100 Sobic003G234500--Sobic009G189700 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic003G234500--Sobic004G180100 Sobic008G122800 Sobic008G122800 Sobic003G234500--Sobic008G122800 Sobic003G110932 Sobic003G110932 Sobic003G234500--Sobic003G110932
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.