Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G404500.1
Synonym Sb02g041890
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X4R5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G140600 targeting protein for Xklp2 containing protein, expressed -
2 Sobic.003G377300 expressed protein K11643: CHD4, chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
3 Sobic.002G322700 expressed protein -
4 Sobic.009G084800 - -
5 Sobic.006G152700 - -
6 Sobic.009G136000 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
7 Sobic.008G155900 ankyrin-1, putative, expressed -
8 Sobic.007G146200 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
9 Sobic.005G008850 - -
10 Sobic.004G313400 transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed K15172: SUPT5H, transcription elongation factor SPT5
11 Sobic.008G188800 ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G168100 expressed protein -
13 Sobic.009G125800 expressed protein -
14 Sobic.002G151500 R-interacting factor 1, putative, expressed -
15 Sobic.004G021000 cyclin-dependent kinase A-2, putative, expressed K02206: cyclin-dependent kinase 2
16 Sobic.007G017100 - -
17 Sobic.002G052800 FAR1 family protein, expressed -
18 Sobic.007G116000 EDM2, putative, expressed -
19 Sobic.001G323900 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G084700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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