Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G180800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q408
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G098800 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
2 Sobic.002G107600 aldehyde oxidase, putative, expressed -
3 Sobic.007G182000 hydroxymethylglutaryl-CoA synthase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative, expressed K01641: hydroxymethylglutaryl-CoA synthase
4 Sobic.001G446850 - -
5 Sobic.002G171101 - -
6 Sobic.003G348000 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G169400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.003G150100 expressed protein -
9 Sobic.001G110701 - -
10 Sobic.004G188500 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed K15272: solute carrier family 35 (UDP-sugar transporter), member A1/2/3
11 Sobic.007G016800 OsFBL26 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.004G102750 - -
13 Sobic.008G167600 VTC2, putative, expressed -
14 Sobic.002G296500 dihydroneopterin aldolase, putative, expressed K01633: 7,8-dihydroneopterin aldolase/epimerase/oxygenase
15 Sobic.010G163400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G243800 BPI/LBP family protein At3g20270 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.010G186100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
18 Sobic.003G043200 EMB2410, putative, expressed -
19 Sobic.002G212500 expressed protein -
20 Sobic.010G020800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14270: aminotransferase


Gene co-expression network
sample Sobic003G180800 Sobic003G180800 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic003G180800--Sobic007G098800 Sobic002G107600 Sobic002G107600 Sobic003G180800--Sobic002G107600 Sobic007G182000 Sobic007G182000 Sobic003G180800--Sobic007G182000 Sobic001G446850 Sobic001G446850 Sobic003G180800--Sobic001G446850 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic003G180800--Sobic002G171101 Sobic003G348000 Sobic003G348000 Sobic003G180800--Sobic003G348000 Sobic002G169400 Sobic002G169400 Sobic003G180800--Sobic002G169400 Sobic003G150100 Sobic003G150100 Sobic003G180800--Sobic003G150100 Sobic001G110701 Sobic001G110701 Sobic003G180800--Sobic001G110701 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic007G098800--Sobic003G180600 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic007G098800--Sobic007G095300 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic007G098800--Sobic003G232001 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic007G098800--Sobic001G419600 Sobic002G296500 Sobic002G296500 Sobic007G098800--Sobic002G296500 Sobic007G098800--Sobic002G171101 Sobic010G163400 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Octagon: transcription factors


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