Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G251200.1
Synonym Sb03g030720
Functional annotation S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q581
Pfam PF00954 PF01453 PF00069
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF11
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G34300 : lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g47820.1 : S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028110
Brachypodium KQK09119 , KQK09112
Barley HORVU3Hr1G061410.8 , HORVU3Hr1G061410.3 , HORVU3Hr1G061410.2 , HORVU3Hr1G061410.1 , HORVU3Hr1G061410.7 , HORVU3Hr1G061410.5
Wheat TraesCS3D02G245200 , TraesCS3D02G245200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
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3 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
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12 Sobic.007G179100 - -
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14 Sobic.009G035000 expressed protein -
15 Sobic.001G534132 - -
16 Sobic.004G264900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00817: histidinol-phosphate aminotransferase
17 Sobic.005G216833 - -
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20 Sobic.001G479900 pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G251200 Sobic003G251200 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic003G251200--Sobic003G068100 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G251200--Sobic006G083050 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G251200--Sobic008G142500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G251200--Sobic005G116800 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic003G251200--Sobic005G041150 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G251200--Sobic003G067900 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G251200--Sobic009G134700 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic003G251200--Sobic010G156300 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G251200--Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic003G067900--Sobic001G534132 Sobic003G067900--Sobic003G068100 Sobic003G272001 Sobic003G272001 Sobic003G067900--Sobic003G272001 Sobic003G067900--Sobic005G116800 Sobic003G067900--Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G159500 Sobic003G067900--Sobic008G142500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic003G067900--Sobic004G264900 Sobic003G067900--Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic006G159500 Sobic009G134700--Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic006G083050 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G134700--Sobic005G216833 Sobic009G134700--Sobic007G179100 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic002G319900 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic009G134700--Sobic004G313000 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 Sobic001G326500--Sobic008G142500 Sobic001G326500--Sobic009G173700 Sobic001G326500--Sobic006G083050 Sobic001G326500--Sobic003G068100 Sobic001G326500--Sobic005G116800 Sobic001G326500--Sobic002G421100 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic001G014600 Sobic001G326500--Sobic006G221500
Octagon: transcription factors


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