Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G004900.1
Synonym Sb04g000630
Functional annotation prenyltransferase, putative, expressed
UniProt C5XRK3
Pfam PF01239
Panther DB PTHR11129 PTHR11129:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14137; protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing protein 1
Gene Ontology GO:0018342; protein prenylation GO:0008318protein prenyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10095 : Protein prenylyltransferase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g49060.1 : prenyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018650
Brachypodium KQK23520 , KQK23521 , KQK23519 , KQK23523 , KQK23522 , KQK23524
Barley -
Wheat TraesCS4D02G134000 , TraesCS4A02G179100 , TraesCS4B02G139300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G004900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G004900 Sobic004G004900 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic004G004900--Sobic003G168100 Sobic006G252900 Sobic006G252900 Sobic004G004900--Sobic006G252900 Sobic004G158400 Sobic004G158400 Sobic004G004900--Sobic004G158400 Sobic005G167700 Sobic005G167700 Sobic004G004900--Sobic005G167700 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic004G004900--Sobic002G425500 Sobic004G131300 Sobic004G131300 Sobic004G004900--Sobic004G131300 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic004G004900--Sobic009G132700 Sobic004G140600 Sobic004G140600 Sobic004G004900--Sobic004G140600 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic004G004900--Sobic001G433800 Sobic010G126000 Sobic010G126000 Sobic003G168100--Sobic010G126000 Sobic003G168100--Sobic005G167700 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic003G168100--Sobic009G129100 Sobic008G044100 Sobic008G044100 Sobic003G168100--Sobic008G044100 Sobic003G168100--Sobic001G433800 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic003G168100--Sobic003G398700 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic003G168100--Sobic004G244900 Sobic004G134200 Sobic004G134200 Sobic003G168100--Sobic004G134200 Sobic004G185800 Sobic004G185800 Sobic003G168100--Sobic004G185800 Sobic006G252900--Sobic001G433800 Sobic006G041600 Sobic006G041600 Sobic006G252900--Sobic006G041600 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic006G252900--Sobic001G363500 Sobic001G441400 Sobic001G441400 Sobic006G252900--Sobic001G441400 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic006G252900--Sobic009G256400 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic006G252900--Sobic006G096900 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G252900--Sobic005G112300 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic006G252900--Sobic005G027400 Sobic009G177500 Sobic009G177500 Sobic006G252900--Sobic009G177500 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic004G158400--Sobic007G159900 Sobic004G158400--Sobic005G167700 Sobic001G261492 Sobic001G261492 Sobic004G158400--Sobic001G261492 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic004G158400--Sobic003G360400 Sobic007G105100 Sobic007G105100 Sobic004G158400--Sobic007G105100 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic004G158400--Sobic010G112100 Sobic004G158400--Sobic001G433800 Sobic004G158400--Sobic005G112300 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic004G158400--Sobic003G188400 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic005G167700--Sobic010G123600 Sobic003G441900 Sobic003G441900 Sobic005G167700--Sobic003G441900 Sobic005G167700--Sobic001G433800 Sobic005G167700--Sobic003G168100 Sobic001G151100 Sobic001G151100 Sobic005G167700--Sobic001G151100 Sobic005G167700--Sobic004G158400 Sobic005G167700--Sobic003G188400 Sobic005G167700--Sobic010G126000 Sobic005G167700--Sobic003G360400 Sobic001G020000 Sobic001G020000 Sobic002G425500--Sobic001G020000 Sobic001G155400 Sobic001G155400 Sobic002G425500--Sobic001G155400 Sobic002G425500--Sobic003G188400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic002G425500--Sobic004G107200 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic002G425500--Sobic007G183900 Sobic002G425500--Sobic004G185800 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic002G425500--Sobic001G227200 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic002G425500--Sobic008G002500 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic002G425500--Sobic004G155600 Sobic002G133300 Sobic002G133300 Sobic004G131300--Sobic002G133300 Sobic002G142900 Sobic002G142900 Sobic004G131300--Sobic002G142900 Sobic005G172500 Sobic005G172500 Sobic004G131300--Sobic005G172500 Sobic009G084900 Sobic009G084900 Sobic004G131300--Sobic009G084900 Sobic004G256500 Sobic004G256500 Sobic004G131300--Sobic004G256500 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic004G131300--Sobic010G059500 Sobic007G054800 Sobic007G054800 Sobic004G131300--Sobic007G054800 Sobic006G136400 Sobic006G136400 Sobic004G131300--Sobic006G136400 Sobic002G256700 Sobic002G256700 Sobic004G131300--Sobic002G256700 Sobic009G132700--Sobic005G027400 Sobic009G132700--Sobic004G140600 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic009G132700--Sobic003G170900 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic009G132700--Sobic001G455600 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic009G132700--Sobic002G211800 Sobic009G132700--Sobic006G252900 Sobic009G132700--Sobic001G433800 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic009G132700--Sobic001G111850 Sobic009G132700--Sobic003G188400 Sobic004G140600--Sobic001G227200 Sobic004G140600--Sobic009G177500 Sobic008G063300 Sobic008G063300 Sobic004G140600--Sobic008G063300 Sobic004G140600--Sobic009G132700 Sobic004G140600--Sobic001G455600 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G140600--Sobic010G139000 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic004G140600--Sobic002G343901 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic004G140600--Sobic001G219600 Sobic004G140600--Sobic001G433800 Sobic001G433800--Sobic010G112100 Sobic001G433800--Sobic003G360400 Sobic007G063000 Sobic007G063000 Sobic001G433800--Sobic007G063000 Sobic001G433800--Sobic005G112300 Sobic004G242400 Sobic004G242400 Sobic001G433800--Sobic004G242400 Sobic001G433800--Sobic002G133300 Sobic001G433800--Sobic001G363500 Sobic001G433800--Sobic006G252900 Sobic001G433800--Sobic006G041600
Octagon: transcription factors


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