Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G112900.4,Sobic.004G112900.1,Sobic.004G112900.3,Sobic.004G112900.2
Synonym Sb04g009220
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XZ58
Pfam -
Panther DB PTHR36076
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57230 : Thioredoxin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g28740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028659
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G301100 PQ loop repeat domain containing protein, expressed K09660: mannose-P-dolichol utilization defect 1
2 Sobic.002G431000 transporter, putative, expressed -
3 Sobic.001G457700 expressed protein -
4 Sobic.002G295700 transporter family protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G173700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G096700 xaa-Pro dipeptidase, putative, expressed K14213: Xaa-Pro dipeptidase
7 Sobic.003G377000 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
8 Sobic.004G254800 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K19371: DnaJ homolog subfamily C member 25
9 Sobic.010G044800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G106300 - K17675: SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1/SUV3
11 Sobic.006G203300 GPR89A, putative, expressed -
12 Sobic.003G084000 transporter family protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G090300 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G498800 UAA transporter family domain containing protein, expressed K15272: solute carrier family 35 (UDP-sugar transporter), member A1/2/3
15 Sobic.003G305900 expressed protein -
16 Sobic.004G236200 SEC6, putative, expressed K06110: EXOC3, exocyst complex component 3
17 Sobic.002G095100 RNA-binding region RNP-1, putative, expressed -
18 Sobic.002G265300 acyl-coenzyme A thioesterase 10, mitochondrial precursor, putative, expressed K17361: acyl-coenzyme A thioesterase 9
19 Sobic.010G184300 glycosyltransferase family protein, putative, expressed K00771: protein xylosyltransferase
20 Sobic.003G291900 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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