Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G182100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YQH6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G182100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G087866 - -
2 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
3 Sobic.002G366400 histone deacetylase, putative, expressed K11407: histone deacetylase 6
4 Sobic.001G441400 transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
5 Sobic.003G443100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
6 Sobic.009G010600 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
7 Sobic.004G072100 centromere/kinetochore protein zw10, putative, expressed K11578: ZW10, protein transport protein DSL1/ZW10
8 Sobic.001G536400 THO complex subunit 1, putative, expressed K12878: THO complex subunit 1
9 Sobic.003G408600 GYF domain containing protein, putative, expressed K18730: PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein
10 Sobic.002G299700 ATGRIP/GRIP, putative, expressed -
11 Sobic.001G281100 START domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G252100 DDT, putative, expressed -
14 Sobic.001G363500 DIRP family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G182201 - -
16 Sobic.010G118950 - -
17 Sobic.001G058700 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
18 Sobic.002G275600 RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed K10754: replication factor C subunit 1
19 Sobic.002G397500 SAC3/GANP family protein, expressed -
20 Sobic.001G474600 calmodulin-binding transcription activator, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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