Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G314900.1
Synonym Sb04g034665
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YSP0
Pfam PF08879
Panther DB PTHR34122
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42040 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g53360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022287 , Zm00025a049611 , Zm00025a033051 , Zm00025a022288
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G117100 protein kinase, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
2 Sobic.003G409600 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
3 Sobic.010G052400 SET domain containing protein, expressed K11430: [histone H3]-lysine27 N-trimethyltransferase EZH2
4 Sobic.006G272300 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.002G271400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G306100 expressed protein -
7 Sobic.003G354500 methyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.003G013800 expressed protein -
9 Sobic.001G033300 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G095200 Peptidase family C50, putative, expressed K02365: separase
11 Sobic.001G196800 CAMK_CAMK_like.40 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
12 Sobic.008G018200 transporter-related, putative, expressed K15285: solute carrier family 35, member E3
13 Sobic.003G364900 hemerythrin family protein, expressed -
14 Sobic.006G127200 kelch repeat protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G425200 expressed protein -
16 Sobic.010G253200 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K12446: L-arabinokinase
17 Sobic.003G336900 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G020000 expressed protein K06947: GRC3, polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase GRC3/NOL9
19 Sobic.001G528100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.002G404300 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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