Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G320200.3
Synonym
Functional annotation glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RPZ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G16040 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03690.1 : glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis protein 11, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053471 , Zm00025a000399
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G082720.8 , HORVU4Hr1G082720.1
Wheat TraesCS4D02G319000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G063450 - -
2 Sobic.009G063500 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.009G031450 - -
4 Sobic.006G062200 DNA cross-link repair 1A protein, putative, expressed K15340: DCLRE1A, SNM1A, DNA cross-link repair 1A protein
5 Sobic.002G057050 - -
6 Sobic.003G157100 importin subunit alpha, putative, expressed -
7 Sobic.004G313700 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
8 Sobic.007G208400 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.001G106300 fanconi anemia L, putative, expressed K10606: FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL
10 Sobic.004G174800 expressed protein -
11 Sobic.001G443300 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03353: APC6, anaphase-promoting complex subunit 6
12 Sobic.002G241700 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
13 Sobic.002G135100 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K02326: DNA polymerase epsilon subunit 3
14 Sobic.006G099600 - -
15 Sobic.004G159600 - -
16 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
17 Sobic.001G521900 CHCH domain containing protein, expressed K18183: cytochrome c oxidase assembly protein subunit 19
18 Sobic.008G009000 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.001G327400 - -
20 Sobic.007G191300 serine/threonine-protein kinase NAK, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4


Gene co-expression network
sample Sobic004G320200 Sobic004G320200 Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic004G320200--Sobic009G063450 Sobic009G063500 Sobic009G063500 Sobic004G320200--Sobic009G063500 Sobic009G031450 Sobic009G031450 Sobic004G320200--Sobic009G031450 Sobic006G062200 Sobic006G062200 Sobic004G320200--Sobic006G062200 Sobic002G057050 Sobic002G057050 Sobic004G320200--Sobic002G057050 Sobic003G157100 Sobic003G157100 Sobic004G320200--Sobic003G157100 Sobic004G313700 Sobic004G313700 Sobic004G320200--Sobic004G313700 Sobic007G208400 Sobic007G208400 Sobic004G320200--Sobic007G208400 Sobic001G106300 Sobic001G106300 Sobic004G320200--Sobic001G106300 Sobic001G535300 Sobic001G535300 Sobic009G063450--Sobic001G535300 Sobic002G128750 Sobic002G128750 Sobic009G063450--Sobic002G128750 Sobic009G063450--Sobic002G057050 Sobic009G063450--Sobic009G031450 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic009G063450--Sobic004G290400 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic009G063450--Sobic002G085700 Sobic001G482500 Sobic001G482500 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Sobic001G106300--Sobic003G130500 Sobic002G123600 Sobic002G123600 Sobic001G106300--Sobic002G123600 Sobic001G500500 Sobic001G500500 Sobic001G106300--Sobic001G500500
Octagon: transcription factors


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