Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G131301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ08
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF152
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47110 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041926 , Zm00025a029814
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G039970.2 , HORVU0Hr1G039970.3 , HORVU0Hr1G039970.1 , HORVU0Hr1G039970.6 , HORVU0Hr1G039970.7 , HORVU0Hr1G039970.4 , HORVU0Hr1G039970.5
Wheat TraesCS7B02G378300 , TraesCS7B02G377900 , TraesCS7A02G476700 , TraesCS7A02G476800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G246100 X8 domain containing protein, expressed -
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20 Sobic.002G376100 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 6 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G131301 Sobic005G131301 Sobic009G246100 Sobic009G246100 Sobic005G131301--Sobic009G246100 Sobic005G131200 Sobic005G131200 Sobic005G131301--Sobic005G131200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G131301--Sobic002G081850 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G131301--Sobic005G197350 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G131301--Sobic005G066300 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G131301--Sobic005G066500 Sobic001G163800 Sobic001G163800 Sobic005G131301--Sobic001G163800 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G131301--Sobic007G119750 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G131301--Sobic005G066200 Sobic009G246100--Sobic001G163800 Sobic010G045400 Sobic010G045400 Sobic009G246100--Sobic010G045400 Sobic005G177400 Sobic005G177400 Sobic009G246100--Sobic005G177400 Sobic005G022500 Sobic005G022500 Sobic009G246100--Sobic005G022500 Sobic003G368000 Sobic003G368000 Sobic009G246100--Sobic003G368000 Sobic003G017601 Sobic003G017601 Sobic009G246100--Sobic003G017601 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic009G246100--Sobic001G503000 Sobic009G246100--Sobic005G131301 Sobic005G018200 Sobic005G018200 Sobic009G246100--Sobic005G018200 Sobic008G035700 Sobic008G035700 Sobic005G131200--Sobic008G035700 Sobic005G131200--Sobic005G066300 Sobic006G229100 Sobic006G229100 Sobic005G131200--Sobic006G229100 Sobic005G131200--Sobic005G197350 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic005G131200--Sobic010G096700 Sobic005G131200--Sobic005G066200 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic005G131200--Sobic001G506700 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G131200--Sobic002G411000 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic005G131200--Sobic001G506600 Sobic002G081850--Sobic005G197350 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic002G081850--Sobic005G066366 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G066500 Sobic002G081850--Sobic005G066300 Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G411000 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic002G081850--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic002G081850--Sobic005G065700 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic005G066300--Sobic002G411000 Sobic005G066300--Sobic004G312500 Sobic005G066300--Sobic001G506700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G066300--Sobic005G071900 Sobic005G066300--Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic005G197350 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic002G081850 Sobic005G066300--Sobic005G066500 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic001G163800--Sobic005G022500 Sobic004G193500 Sobic004G193500 Sobic001G163800--Sobic004G193500 Sobic001G250100 Sobic001G250100 Sobic001G163800--Sobic001G250100 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic001G163800--Sobic003G287200 Sobic008G133000 Sobic008G133000 Sobic001G163800--Sobic008G133000 Sobic001G002800 Sobic001G002800 Sobic001G163800--Sobic001G002800 Sobic001G163800--Sobic001G503000 Sobic001G471800 Sobic001G471800 Sobic001G163800--Sobic001G471800 Sobic009G250100 Sobic009G250100 Sobic001G163800--Sobic009G250100 Sobic007G119750--Sobic005G066200 Sobic007G119750--Sobic005G197350 Sobic007G119750--Sobic005G066500 Sobic007G119750--Sobic002G019000 Sobic010G126800 Sobic010G126800 Sobic007G119750--Sobic010G126800 Sobic007G119750--Sobic005G065700 Sobic007G119750--Sobic010G242800 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic007G119750--Sobic007G064900 Sobic007G119750--Sobic005G110511 Sobic005G066200--Sobic007G119750 Sobic005G066200--Sobic005G197350 Sobic005G066200--Sobic010G126800 Sobic005G066200--Sobic005G066366 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic005G066200--Sobic004G008300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic005G066500 Sobic005G066200--Sobic002G019000 Sobic005G066200--Sobic010G242800
Octagon: transcription factors


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