Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G222900.1
Synonym
Functional annotation RGH1A, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RK00
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF484
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g07330.2 : RGH1A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015734 , Zm00025a041608
Brachypodium KQK08071
Barley -
Wheat TraesCS6D02G005300 , TraesCS5A02G340600 , TraesCS7A02G008500 , TraesCS2B02G039200 , TraesCS6B02G000100 , TraesCS2B02G039100 , TraesCS2B02G038800
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cDNA sequences
Sobic.005G222900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G386600 calreticulin precursor protein, putative, expressed K08057: calreticulin
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20 Sobic.003G221800 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G222900 Sobic005G222900 Sobic003G386600 Sobic003G386600 Sobic005G222900--Sobic003G386600 Sobic003G210801 Sobic003G210801 Sobic005G222900--Sobic003G210801 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic005G222900--Sobic006G249050 Sobic005G188600 Sobic005G188600 Sobic005G222900--Sobic005G188600 Sobic004G088100 Sobic004G088100 Sobic005G222900--Sobic004G088100 Sobic003G397200 Sobic003G397200 Sobic005G222900--Sobic003G397200 Sobic003G263001 Sobic003G263001 Sobic005G222900--Sobic003G263001 Sobic001G098301 Sobic001G098301 Sobic005G222900--Sobic001G098301 Sobic008G022300 Sobic008G022300 Sobic005G222900--Sobic008G022300 Sobic003G386600--Sobic005G222900 Sobic003G386600--Sobic005G188600 Sobic004G269000 Sobic004G269000 Sobic003G386600--Sobic004G269000 Sobic006G228500 Sobic006G228500 Sobic003G386600--Sobic006G228500 Sobic001G427300 Sobic001G427300 Sobic003G386600--Sobic001G427300 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic003G386600--Sobic010G005600 Sobic001G035900 Sobic001G035900 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Octagon: transcription factors


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