Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G002000.2,Sobic.006G002000.1,Sobic.006G002000.6,Sobic.006G002000.4,Sobic.006G002000.3,Sobic.006G002000.5
Synonym Sb06g000370
Functional annotation phosphoglycerate mutase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RB90 , A0A1B6PJA9 , A0A1Z5RB99 , A0A1B6PJA3 , A0A1B6PJB8
Pfam PF00300
Panther DB PTHR23029 PTHR23029:SF40
NCBI CDD KOG4754; Predicted phosphoglycerate mutase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64460 : Phosphoglycerate mutase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01230.1 : phosphoglycerate mutase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055525 , Zm00025a012180
Brachypodium KQJ81702
Barley HORVU2Hr1G006280.8 , HORVU2Hr1G006280.9 , HORVU2Hr1G006320.1 , HORVU2Hr1G006280.1 , HORVU2Hr1G006280.2 , HORVU2Hr1G006280.4 , HORVU2Hr1G006280.5 , HORVU2Hr1G006280.6 , HORVU2Hr1G006280.7 , HORVU2Hr1G006280.29 , HORVU2Hr1G006280.28 , HORVU2Hr1G006280.27 , HORVU2Hr1G006280.12 , HORVU2Hr1G006280.11 , HORVU2Hr1G006280.30 , HORVU2Hr1G006280.32
Wheat TraesCS2A02G042300 , TraesCS2D02G041100 , TraesCS2D02G041100 , TraesCS2A02G042100 , TraesCS2A02G042100 , TraesCS2B02G054600 , TraesCS2D02G041000 , TraesCS2D02G041000
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cDNA sequences
Sobic.006G002000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G365300 sorting nexin 1, putative, expressed K17917: sorting nexin-1/2
2 Sobic.010G139600 STE_PAK_Ste20_STLK.5 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
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4 Sobic.003G006300 expressed protein -
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16 Sobic.001G375100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G157000 expressed protein -
18 Sobic.009G068500 expressed protein -
19 Sobic.002G111000 peptidase, putative, expressed -
20 Sobic.005G001000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K10643: CNOT4, NOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4


Gene co-expression network
sample Sobic006G002000 Sobic006G002000 Sobic003G365300 Sobic003G365300 Sobic006G002000--Sobic003G365300 Sobic010G139600 Sobic010G139600 Sobic006G002000--Sobic010G139600 Sobic007G133700 Sobic007G133700 Sobic006G002000--Sobic007G133700 Sobic003G006300 Sobic003G006300 Sobic006G002000--Sobic003G006300 Sobic008G098900 Sobic008G098900 Sobic006G002000--Sobic008G098900 Sobic007G075400 Sobic007G075400 Sobic006G002000--Sobic007G075400 Sobic010G072400 Sobic010G072400 Sobic006G002000--Sobic010G072400 Sobic006G087700 Sobic006G087700 Sobic006G002000--Sobic006G087700 Sobic003G198800 Sobic003G198800 Sobic006G002000--Sobic003G198800 Sobic001G390800 Sobic001G390800 Sobic003G365300--Sobic001G390800 Sobic003G365300--Sobic006G002000 Sobic006G082400 Sobic006G082400 Sobic003G365300--Sobic006G082400 Sobic004G275700 Sobic004G275700 Sobic003G365300--Sobic004G275700 Sobic002G111000 Sobic002G111000 Sobic003G365300--Sobic002G111000 Sobic001G203900 Sobic001G203900 Sobic003G365300--Sobic001G203900 Sobic009G068500 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Octagon: transcription factors


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