Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G016000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJG6
Pfam -
Panther DB PTHR33075 PTHR33075:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G017500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.005G089400 - -
3 Sobic.008G166550 - -
4 Sobic.010G145500 expressed protein -
5 Sobic.004G239700 - -
6 Sobic.001G223550 - -
7 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
8 Sobic.003G416000 - -
9 Sobic.004G143475 - -
10 Sobic.010G125300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.006G219600 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
12 Sobic.001G438700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
13 Sobic.008G150100 resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G431500 - -
15 Sobic.005G133600 - -
16 Sobic.009G220500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G224800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
18 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
19 Sobic.006G017332 - -
20 Sobic.002G005800 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G016000 Sobic006G016000 Sobic006G017500 Sobic006G017500 Sobic006G016000--Sobic006G017500 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic006G016000--Sobic005G089400 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic006G016000--Sobic008G166550 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic006G016000--Sobic010G145500 Sobic004G239700 Sobic004G239700 Sobic006G016000--Sobic004G239700 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic006G016000--Sobic001G223550 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic006G016000--Sobic001G517800 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G016000--Sobic003G416000 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic006G016000--Sobic004G143475 Sobic010G125300 Sobic010G125300 Sobic006G017500--Sobic010G125300 Sobic006G017400 Sobic006G017400 Sobic006G017500--Sobic006G017400 Sobic006G017500--Sobic006G016000 Sobic006G017332 Sobic006G017332 Sobic006G017500--Sobic006G017332 Sobic001G282600 Sobic001G282600 Sobic006G017500--Sobic001G282600 Sobic004G225200 Sobic004G225200 Sobic006G017500--Sobic004G225200 Sobic001G150650 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Octagon: transcription factors


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