Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G029700.1
Synonym Sb06g003053, SDP6
Functional annotation FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed
UniProt C5YD62
Pfam PF00890 PF16901
Panther DB PTHR11985 PTHR11985:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00111; glpA, glycerol-3-phosphate dehydrogenase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G10370 : FAD-dependent oxidoreductase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g14790.1 : FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055558
Brachypodium KQJ81920 , PNT60742
Barley HORVU2Hr1G010130.4 , HORVU2Hr1G010130.1 , HORVU2Hr1G010130.3 , HORVU2Hr1G010130.2
Wheat TraesCS2A02G070500 , TraesCS2D02G069500 , TraesCS2B02G084200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G029700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G112700 glutamine-dependent NAD, putative, expressed K01950: E6.3.5.1, NADSYN1, QNS1, NAD+ synthase (glutamine-hydrolysing)
2 Sobic.002G408200 sec8 exocyst complex component specific domain containing protein, expressed K06111: EXOC4, exocyst complex component 4
3 Sobic.009G040600 expressed protein K11647: SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 2/4
4 Sobic.007G011300 SGR2, putative, expressed -
5 Sobic.002G154000 EDM2, putative, expressed -
6 Sobic.006G116100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G113100 protein binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G218000 chloride transporter, chloride channel family, putative, expressed -
9 Sobic.008G047800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K15361: WDR48, WD repeat-containing protein 48
10 Sobic.004G084700 - -
11 Sobic.007G008900 SAC domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G125000 OsAPRL4 adenosine 5\'-phosphosulfate reductase-like OsAPRL4, expressed -
13 Sobic.010G069100 expressed protein -
14 Sobic.002G260400 - -
15 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
16 Sobic.008G153000 MATH domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G059750 - K11797: PHIP, PH-interacting protein
18 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G132100 myrosinase precursor, putative, expressed -
20 Sobic.006G008600 zinc finger family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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