Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G046100.2
Synonym UBP24
Functional annotation ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RD30
Pfam -
Panther DB PTHR24006 PTHR24006:SF529
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30890 : ubiquitin-specific protease 24
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46660.1 : ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049046 , Zm00025a015365
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G090400 OsRR1 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
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20 Sobic.005G110547 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G046100 Sobic006G046100 Sobic006G090400 Sobic006G090400 Sobic006G046100--Sobic006G090400 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic006G046100--Sobic009G070250 Sobic001G300800 Sobic001G300800 Sobic006G046100--Sobic001G300800 Sobic010G093500 Sobic010G093500 Sobic006G046100--Sobic010G093500 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic006G046100--Sobic005G102350 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic006G046100--Sobic005G127900 Sobic010G094301 Sobic010G094301 Sobic006G046100--Sobic010G094301 Sobic006G090300 Sobic006G090300 Sobic006G046100--Sobic006G090300 Sobic001G344400 Sobic001G344400 Sobic006G046100--Sobic001G344400 Sobic006G090400--Sobic006G090300 Sobic006G090400--Sobic001G344400 Sobic007G005850 Sobic007G005850 Sobic006G090400--Sobic007G005850 Sobic002G329400 Sobic002G329400 Sobic006G090400--Sobic002G329400 Sobic003G237600 Sobic003G237600 Sobic006G090400--Sobic003G237600 Sobic010G030800 Sobic010G030800 Sobic006G090400--Sobic010G030800 Sobic001G189100 Sobic001G189100 Sobic006G090400--Sobic001G189100 Sobic002G213000 Sobic002G213000 Sobic006G090400--Sobic002G213000 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic004G095000 Sobic004G095000 Sobic001G300800--Sobic004G095000 Sobic001G300800--Sobic010G093500 Sobic003G338801 Sobic003G338801 Sobic001G300800--Sobic003G338801 Sobic001G300800--Sobic010G094301 Sobic003G069100 Sobic003G069100 Sobic001G300800--Sobic003G069100 Sobic001G301600 Sobic001G301600 Sobic001G300800--Sobic001G301600 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic001G300800--Sobic001G361700 Sobic001G262301 Sobic001G262301 Sobic001G300800--Sobic001G262301 Sobic001G300800--Sobic002G213000 Sobic006G127350 Sobic006G127350 Sobic010G093500--Sobic006G127350 Sobic010G093500--Sobic010G030800 Sobic010G093500--Sobic004G095000 Sobic010G093500--Sobic003G069100 Sobic008G067200 Sobic008G067200 Sobic010G093500--Sobic008G067200 Sobic010G093500--Sobic001G300800 Sobic005G202600 Sobic005G202600 Sobic010G093500--Sobic005G202600 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic010G093500--Sobic008G105850 Sobic003G131000 Sobic003G131000 Sobic010G093500--Sobic003G131000 Sobic005G102350--Sobic005G110547 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G102350--Sobic002G240500 Sobic001G027500 Sobic001G027500 Sobic005G102350--Sobic001G027500 Sobic005G102350--Sobic005G115350 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic005G102350--Sobic010G165800 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G102350--Sobic010G165900 Sobic005G102350--Sobic010G165700 Sobic005G102350--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic005G102350--Sobic009G051800 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic003G057900 Sobic003G057900 Sobic010G094301--Sobic003G057900 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic010G094301--Sobic001G353800 Sobic001G192100 Sobic001G192100 Sobic010G094301--Sobic001G192100 Sobic009G132900 Sobic009G132900 Sobic010G094301--Sobic009G132900 Sobic006G234100 Sobic006G234100 Sobic010G094301--Sobic006G234100 Sobic010G109500 Sobic010G109500 Sobic010G094301--Sobic010G109500 Sobic002G339200 Sobic002G339200 Sobic010G094301--Sobic002G339200 Sobic001G448400 Sobic001G448400 Sobic010G094301--Sobic001G448400 Sobic006G264201 Sobic006G264201 Sobic010G094301--Sobic006G264201 Sobic006G090300--Sobic006G090400 Sobic009G243500 Sobic009G243500 Sobic006G090300--Sobic009G243500 Sobic006G090300--Sobic002G213000 Sobic005G030500 Sobic005G030500 Sobic006G090300--Sobic005G030500 Sobic006G090300--Sobic003G237600 Sobic001G068400 Sobic001G068400 Sobic006G090300--Sobic001G068400 Sobic006G090300--Sobic001G189100 Sobic006G090300--Sobic010G030800 Sobic001G344400--Sobic002G329400 Sobic001G344400--Sobic006G090400 Sobic001G344400--Sobic007G005850 Sobic001G344400--Sobic005G202600 Sobic001G344400--Sobic010G030800 Sobic004G018150 Sobic004G018150 Sobic001G344400--Sobic004G018150 Sobic009G222200 Sobic009G222200 Sobic001G344400--Sobic009G222200 Sobic001G344400--Sobic001G361700 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic001G344400--Sobic003G199800
Octagon: transcription factors


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