Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G057000.2,Sobic.006G057000.3
Synonym Sb06g014520
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RD65
Pfam -
Panther DB PTHR10825 PTHR10825:SF40
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28080 : RING finger protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011681
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G132800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CAMK_CAMK_like.21 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
2 Sobic.008G081400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide transporter PTR3-A, putative, expressed -
3 Sobic.008G119700 NB-ARC domain containing disease resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G110508 - -
5 Sobic.005G079400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
6 Sobic.005G066366 - -
7 Sobic.005G110511 - -
8 Sobic.001G506700 exostosin family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G187600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
10 Sobic.005G197350 - -
11 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G317300 "a rapidly evolving gene family, termed Rp1/Pi37, which had an effector response that confers resistance to multiple pathogens across species."(PubMedID : 25928459)@rp1, putative, expressed -
13 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
14 Sobic.002G081850 - -
15 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G093500 expressed protein -
17 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
18 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
20 Sobic.010G219800 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G057000 Sobic006G057000 Sobic001G132800 Sobic001G132800 Sobic006G057000--Sobic001G132800 Sobic008G081400 Sobic008G081400 Sobic006G057000--Sobic008G081400 Sobic008G119700 Sobic008G119700 Sobic006G057000--Sobic008G119700 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic006G057000--Sobic005G110508 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic006G057000--Sobic005G079400 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic006G057000--Sobic005G066366 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic006G057000--Sobic005G110511 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic006G057000--Sobic001G506700 Sobic004G187600 Sobic004G187600 Sobic006G057000--Sobic004G187600 Sobic007G054500 Sobic007G054500 Sobic001G132800--Sobic007G054500 Sobic001G396400 Sobic001G396400 Sobic001G132800--Sobic001G396400 Sobic005G110490 Sobic005G110490 Sobic001G132800--Sobic005G110490 Sobic010G035900 Sobic010G035900 Sobic001G132800--Sobic010G035900 Sobic006G156600 Sobic006G156600 Sobic001G132800--Sobic006G156600 Sobic002G112300 Sobic002G112300 Sobic001G132800--Sobic002G112300 Sobic001G108350 Sobic001G108350 Sobic001G132800--Sobic001G108350 Sobic007G009500 Sobic007G009500 Sobic001G132800--Sobic007G009500 Sobic006G185900 Sobic006G185900 Sobic001G132800--Sobic006G185900 Sobic009G181300 Sobic009G181300 Sobic008G081400--Sobic009G181300 Sobic006G274500 Sobic006G274500 Sobic008G081400--Sobic006G274500 Sobic004G349300 Sobic004G349300 Sobic008G081400--Sobic004G349300 Sobic003G385500 Sobic003G385500 Sobic008G081400--Sobic003G385500 Sobic002G027700 Sobic002G027700 Sobic008G081400--Sobic002G027700 Sobic003G417000 Sobic003G417000 Sobic008G081400--Sobic003G417000 Sobic008G074500 Sobic008G074500 Sobic008G081400--Sobic008G074500 Sobic002G067300 Sobic002G067300 Sobic008G081400--Sobic002G067300 Sobic008G097300 Sobic008G097300 Sobic008G081400--Sobic008G097300 Sobic005G057401 Sobic005G057401 Sobic008G119700--Sobic005G057401 Sobic002G028566 Sobic002G028566 Sobic008G119700--Sobic002G028566 Sobic001G070100 Sobic001G070100 Sobic008G119700--Sobic001G070100 Sobic008G119700--Sobic004G187600 Sobic004G089100 Sobic004G089100 Sobic008G119700--Sobic004G089100 Sobic004G178600 Sobic004G178600 Sobic008G119700--Sobic004G178600 Sobic005G048400 Sobic005G048400 Sobic008G119700--Sobic005G048400 Sobic007G005100 Sobic007G005100 Sobic008G119700--Sobic007G005100 Sobic008G119700--Sobic006G057000 Sobic005G110508--Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110508--Sobic005G066500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic004G312500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066366 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110508--Sobic005G071900 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic002G411000 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G079400 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic001G506700--Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic005G065700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic005G071900 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic001G506600 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic001G506700--Sobic006G209000 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic005G066300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic001G506700--Sobic001G503000 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic004G187600--Sobic009G225800 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic004G187600--Sobic005G212800 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G187600--Sobic009G136800 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic004G187600--Sobic001G234100 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic004G187600--Sobic005G101000 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic004G187600--Sobic004G299500 Sobic005G219500 Sobic005G219500 Sobic004G187600--Sobic005G219500 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic004G187600--Sobic001G395900 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic004G187600--Sobic006G230100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.