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Transcriptome id Sobic.006G223400.1
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Functional annotation -
UniProt C5YG88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G020000 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.010G015700 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.002G105101 - -
4 Sobic.008G147200 tubulin, putative, expressed -
5 Sobic.001G013300 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G334100 1-5-phosphoribosyl-5-5-phosphoribosylaminomethylideneaminoimidazole-4-carboxamide isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed K01814: phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase
7 Sobic.005G000300 RNase P subunit p30, putative, expressed K03539: RPP1, ribonuclease P/MRP protein subunit RPP1
8 Sobic.003G184400 jmjC domain-containing protein 4, putative, expressed -
9 Sobic.003G376500 SET domain containing protein, expressed K05302: N-lysine methyltransferase SETD6
10 Sobic.005G137700 OsFBX409 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G033900 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
12 Sobic.001G373000 nucleoporin interacting component, putative, expressed K14309: NUP93, nuclear pore complex protein Nup93
13 Sobic.008G018800 EMB1379, putative, expressed -
14 Sobic.001G346900 RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed K14292: trimethylguanosine synthase
15 Sobic.004G027400 - -
16 Sobic.005G108000 - -
17 Sobic.005G028100 nucleolar complex protein 2, putative, expressed K14833: nucleolar complex protein 2
18 Sobic.002G005000 expressed protein K14557: U3 small nucleolar RNA-associated protein 6
19 Sobic.004G289400 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G226300 SDA1, putative, expressed K14856: SDA1, protein SDA1


Gene co-expression network
sample Sobic006G223400 Sobic006G223400 Sobic005G020000 Sobic005G020000 Sobic006G223400--Sobic005G020000 Sobic010G015700 Sobic010G015700 Sobic006G223400--Sobic010G015700 Sobic002G105101 Sobic002G105101 Sobic006G223400--Sobic002G105101 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic006G223400--Sobic008G147200 Sobic001G013300 Sobic001G013300 Sobic006G223400--Sobic001G013300 Sobic001G334100 Sobic001G334100 Sobic006G223400--Sobic001G334100 Sobic005G000300 Sobic005G000300 Sobic006G223400--Sobic005G000300 Sobic003G184400 Sobic003G184400 Sobic006G223400--Sobic003G184400 Sobic003G376500 Sobic003G376500 Sobic006G223400--Sobic003G376500 Sobic005G020000--Sobic002G105101 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic005G020000--Sobic001G346900 Sobic005G020000--Sobic006G223400 Sobic005G020000--Sobic008G147200 Sobic005G137700 Sobic005G137700 Sobic005G020000--Sobic005G137700 Sobic005G108000 Sobic005G108000 Sobic005G020000--Sobic005G108000 Sobic010G032300 Sobic010G032300 Sobic005G020000--Sobic010G032300 Sobic002G422100 Sobic002G422100 Sobic005G020000--Sobic002G422100 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic005G020000--Sobic003G409200 Sobic006G226300 Sobic006G226300 Sobic010G015700--Sobic006G226300 Sobic010G015700--Sobic001G334100 Sobic010G015700--Sobic003G184400 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic010G015700--Sobic005G009200 Sobic005G199200 Sobic005G199200 Sobic010G015700--Sobic005G199200 Sobic010G015700--Sobic006G223400 Sobic002G177500 Sobic002G177500 Sobic010G015700--Sobic002G177500 Sobic002G142600 Sobic002G142600 Sobic010G015700--Sobic002G142600 Sobic004G227100 Sobic004G227100 Sobic010G015700--Sobic004G227100 Sobic007G217100 Sobic007G217100 Sobic002G105101--Sobic007G217100 Sobic001G052400 Sobic001G052400 Sobic002G105101--Sobic001G052400 Sobic002G105101--Sobic008G147200 Sobic009G211200 Sobic009G211200 Sobic002G105101--Sobic009G211200 Sobic010G224700 Sobic010G224700 Sobic002G105101--Sobic010G224700 Sobic010G215900 Sobic010G215900 Sobic002G105101--Sobic010G215900 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic002G105101--Sobic004G321700 Sobic009G145101 Sobic009G145101 Sobic002G105101--Sobic009G145101 Sobic002G105101--Sobic003G409200 Sobic008G147200--Sobic004G321700 Sobic008G147200--Sobic005G137700 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic008G147200--Sobic006G269800 Sobic010G186600 Sobic010G186600 Sobic008G147200--Sobic010G186600 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic008G147200--Sobic002G145800 Sobic010G007100 Sobic010G007100 Sobic008G147200--Sobic010G007100 Sobic008G147200--Sobic001G346900 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic008G147200--Sobic003G042400 Sobic001G291800 Sobic001G291800 Sobic008G147200--Sobic001G291800 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic001G013300--Sobic004G285000 Sobic001G373000 Sobic001G373000 Sobic001G013300--Sobic001G373000 Sobic001G013300--Sobic008G147200 Sobic001G013300--Sobic001G346900 Sobic001G004100 Sobic001G004100 Sobic001G013300--Sobic001G004100 Sobic001G013300--Sobic010G215900 Sobic001G013300--Sobic003G409200 Sobic007G187600 Sobic007G187600 Sobic001G013300--Sobic007G187600 Sobic001G023800 Sobic001G023800 Sobic001G013300--Sobic001G023800 Sobic007G143500 Sobic007G143500 Sobic001G334100--Sobic007G143500 Sobic001G334100--Sobic003G184400 Sobic001G334100--Sobic005G199200 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic001G334100--Sobic003G259600 Sobic005G059400 Sobic005G059400 Sobic001G334100--Sobic005G059400 Sobic001G334100--Sobic002G142600 Sobic006G180700 Sobic006G180700 Sobic001G334100--Sobic006G180700 Sobic004G067400 Sobic004G067400 Sobic001G334100--Sobic004G067400 Sobic001G334100--Sobic005G000300 Sobic002G112600 Sobic002G112600 Sobic005G000300--Sobic002G112600 Sobic004G031300 Sobic004G031300 Sobic005G000300--Sobic004G031300 Sobic010G091500 Sobic010G091500 Sobic005G000300--Sobic010G091500 Sobic003G123200 Sobic003G123200 Sobic005G000300--Sobic003G123200 Sobic005G000300--Sobic010G224700 Sobic005G000300--Sobic001G334100 Sobic009G246500 Sobic009G246500 Sobic005G000300--Sobic009G246500 Sobic002G378100 Sobic002G378100 Sobic005G000300--Sobic002G378100 Sobic008G163500 Sobic008G163500 Sobic005G000300--Sobic008G163500 Sobic003G184400--Sobic005G199200 Sobic003G184400--Sobic001G334100 Sobic003G184400--Sobic002G142600 Sobic009G074700 Sobic009G074700 Sobic003G184400--Sobic009G074700 Sobic004G036700 Sobic004G036700 Sobic003G184400--Sobic004G036700 Sobic001G090300 Sobic001G090300 Sobic003G184400--Sobic001G090300 Sobic002G005000 Sobic002G005000 Sobic003G184400--Sobic002G005000 Sobic003G184400--Sobic005G137700 Sobic002G408600 Sobic002G408600 Sobic003G184400--Sobic002G408600 Sobic010G205900 Sobic010G205900 Sobic003G376500--Sobic010G205900 Sobic003G376500--Sobic001G373000 Sobic001G408600 Sobic001G408600 Sobic003G376500--Sobic001G408600 Sobic006G178100 Sobic006G178100 Sobic003G376500--Sobic006G178100 Sobic005G028100 Sobic005G028100 Sobic003G376500--Sobic005G028100 Sobic003G376500--Sobic003G259600 Sobic003G376500--Sobic001G334100 Sobic003G039500 Sobic003G039500 Sobic003G376500--Sobic003G039500 Sobic004G224600 Sobic004G224600 Sobic003G376500--Sobic004G224600
Octagon: transcription factors


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