Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G010300.2
Synonym
Functional annotation OsFBL26 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PEW5
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF86
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49980.1 : OsFBL26 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G171001 - -
2 Sobic.003G325600 expressed protein -
3 Sobic.004G033400 DNA polymerase V, putative, expressed K02331: POL5, DNA polymerase phi
4 Sobic.003G396500 ZOS5-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
5 Sobic.006G061800 - -
6 Sobic.002G299200 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
7 Sobic.008G024100 AT hook motif family protein, expressed -
8 Sobic.002G259301 - K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
9 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
11 Sobic.001G091701 - -
12 Sobic.007G119700 OsFBX8 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G324500 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.010G023600 von Willebrand factor type A domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G095100 RNA-binding region RNP-1, putative, expressed -
16 Sobic.009G025200 HECT-domain domain containing protein, expressed K10590: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12
17 Sobic.003G411300 expressed protein -
18 Sobic.005G048600 expressed protein -
19 Sobic.005G171900 expressed protein -
20 Sobic.002G304700 RFT1, putative, expressed K06316: oligosaccharide translocation protein RFT1


Gene co-expression network
sample Sobic007G010300 Sobic007G010300 Sobic001G171001 Sobic001G171001 Sobic007G010300--Sobic001G171001 Sobic003G325600 Sobic003G325600 Sobic007G010300--Sobic003G325600 Sobic004G033400 Sobic004G033400 Sobic007G010300--Sobic004G033400 Sobic003G396500 Sobic003G396500 Sobic007G010300--Sobic003G396500 Sobic006G061800 Sobic006G061800 Sobic007G010300--Sobic006G061800 Sobic002G299200 Sobic002G299200 Sobic007G010300--Sobic002G299200 Sobic008G024100 Sobic008G024100 Sobic007G010300--Sobic008G024100 Sobic002G259301 Sobic002G259301 Sobic007G010300--Sobic002G259301 Sobic001G218600 Sobic001G218600 Sobic007G010300--Sobic001G218600 Sobic001G171001--Sobic003G396500 Sobic007G012600 Sobic007G012600 Sobic001G171001--Sobic007G012600 Sobic006G152700 Sobic006G152700 Sobic001G171001--Sobic006G152700 Sobic001G171001--Sobic003G325600 Sobic001G171001--Sobic002G299200 Sobic001G288000 Sobic001G288000 Sobic001G171001--Sobic001G288000 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic001G171001--Sobic010G030000 Sobic009G136000 Sobic009G136000 Sobic001G171001--Sobic009G136000 Sobic004G302100 Sobic004G302100 Sobic001G171001--Sobic004G302100 Sobic003G325600--Sobic003G396500 Sobic003G325600--Sobic008G024100 Sobic003G325600--Sobic001G218600 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic003G325600--Sobic001G506400 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic003G325600--Sobic001G135700 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic003G325600--Sobic007G063800 Sobic008G082000 Sobic008G082000 Sobic003G325600--Sobic008G082000 Sobic004G062600 Sobic004G062600 Sobic003G325600--Sobic004G062600 Sobic003G325600--Sobic004G033400 Sobic003G217800 Sobic003G217800 Sobic004G033400--Sobic003G217800 Sobic004G033400--Sobic007G063800 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic004G033400--Sobic007G144100 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic004G033400--Sobic008G007600 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic004G033400--Sobic003G352900 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic004G033400--Sobic003G018000 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic004G033400--Sobic002G013550 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic004G033400--Sobic010G266600 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G033400--Sobic009G220700 Sobic003G396500--Sobic001G218600 Sobic003G396500--Sobic003G325600 Sobic003G090000 Sobic003G090000 Sobic003G396500--Sobic003G090000 Sobic003G396500--Sobic002G299200 Sobic003G027000 Sobic003G027000 Sobic003G396500--Sobic003G027000 Sobic006G215800 Sobic006G215800 Sobic003G396500--Sobic006G215800 Sobic003G396500--Sobic006G152700 Sobic005G070301 Sobic005G070301 Sobic003G396500--Sobic005G070301 Sobic004G313400 Sobic004G313400 Sobic003G396500--Sobic004G313400 Sobic010G270200 Sobic010G270200 Sobic006G061800--Sobic010G270200 Sobic002G254100 Sobic002G254100 Sobic006G061800--Sobic002G254100 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic006G061800--Sobic010G181701 Sobic003G057050 Sobic003G057050 Sobic006G061800--Sobic003G057050 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic006G061800--Sobic004G077300 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic006G061800--Sobic009G007300 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic006G061800--Sobic008G050900 Sobic009G113500 Sobic009G113500 Sobic006G061800--Sobic009G113500 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic006G061800--Sobic001G034200 Sobic002G299200--Sobic003G027000 Sobic002G299200--Sobic003G090000 Sobic002G299200--Sobic003G396500 Sobic009G152120 Sobic009G152120 Sobic002G299200--Sobic009G152120 Sobic002G299200--Sobic001G218600 Sobic002G299200--Sobic006G215800 Sobic002G299200--Sobic002G259301 Sobic002G299200--Sobic001G288000 Sobic002G299200--Sobic005G070301 Sobic008G024100--Sobic003G325600 Sobic005G212100 Sobic005G212100 Sobic008G024100--Sobic005G212100 Sobic008G024100--Sobic008G082000 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic008G024100--Sobic002G061732 Sobic008G024100--Sobic001G034200 Sobic008G024100--Sobic007G063800 Sobic008G024100--Sobic001G506400 Sobic005G166432 Sobic005G166432 Sobic008G024100--Sobic005G166432 Sobic004G355750 Sobic004G355750 Sobic008G024100--Sobic004G355750 Sobic002G259301--Sobic002G299200 Sobic003G142200 Sobic003G142200 Sobic002G259301--Sobic003G142200 Sobic007G193300 Sobic007G193300 Sobic002G259301--Sobic007G193300 Sobic005G164800 Sobic005G164800 Sobic002G259301--Sobic005G164800 Sobic002G259301--Sobic001G288000 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic002G259301--Sobic007G205300 Sobic001G287900 Sobic001G287900 Sobic002G259301--Sobic001G287900 Sobic003G217300 Sobic003G217300 Sobic002G259301--Sobic003G217300 Sobic002G259301--Sobic003G027000 Sobic001G218600--Sobic003G090000 Sobic001G218600--Sobic003G027000 Sobic001G218600--Sobic003G396500 Sobic001G218600--Sobic005G070301 Sobic001G218600--Sobic001G506400 Sobic003G044000 Sobic003G044000 Sobic001G218600--Sobic003G044000 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic001G218600--Sobic007G060100 Sobic010G157200 Sobic010G157200 Sobic001G218600--Sobic010G157200 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic001G218600--Sobic010G263400
Octagon: transcription factors


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