Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G021400.1
Synonym
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt C5YMF6
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17080 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43960.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030228 , Zm00025a030229 , Zm00025a005666 , Zm00025a005660 , Zm00025a030230
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G185300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G110200 - -
3 Sobic.005G110300 - -
4 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
5 Sobic.001G294150 - -
6 Sobic.009G008400 - -
7 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
8 Sobic.003G182600 protein phosphatase 2C containing protein, expressed -
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10 Sobic.001G178700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G169633 - -
12 Sobic.001G292200 dynamin family protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G020500 expressed protein K15198: BDP1, transcription factor TFIIIB component B''
14 Sobic.006G021250 - -
15 Sobic.006G280200 PHD finger family protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G072133 - -
17 Sobic.007G202900 ZOS8-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
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19 Sobic.009G053800 expressed protein -
20 Sobic.002G175050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G021400 Sobic007G021400 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic007G021400--Sobic008G185300 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic007G021400--Sobic005G110200 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic007G021400--Sobic005G110300 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic007G021400--Sobic005G032800 Sobic001G294150 Sobic001G294150 Sobic007G021400--Sobic001G294150 Sobic009G008400 Sobic009G008400 Sobic007G021400--Sobic009G008400 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic007G021400--Sobic007G116200 Sobic003G182600 Sobic003G182600 Sobic007G021400--Sobic003G182600 Sobic010G256700 Sobic010G256700 Sobic007G021400--Sobic010G256700 Sobic008G185300--Sobic005G110200 Sobic008G185300--Sobic005G032800 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic008G185300--Sobic004G263600 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic008G185300--Sobic010G239600 Sobic008G185300--Sobic005G110300 Sobic002G409700 Sobic002G409700 Sobic008G185300--Sobic002G409700 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic008G185300--Sobic002G169633 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic008G185300--Sobic005G209100 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic008G185300--Sobic009G221000 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500 Sobic005G110300--Sobic005G110200 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic005G110300--Sobic002G008900 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic005G110300--Sobic004G174200 Sobic005G110300--Sobic007G116200 Sobic005G110300--Sobic002G169633 Sobic004G010151 Sobic004G010151 Sobic005G110300--Sobic004G010151 Sobic005G110300--Sobic002G134200 Sobic005G110300--Sobic010G239600 Sobic005G110300--Sobic005G032800 Sobic005G032800--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic001G474600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G032800--Sobic002G173000 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic006G021250 Sobic005G032800--Sobic002G134200 Sobic005G032800--Sobic002G169633 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic001G498600 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic005G032800--Sobic010G112000 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic005G032800--Sobic001G292200 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic001G294150--Sobic008G024600 Sobic001G294150--Sobic009G008400 Sobic010G276800 Sobic010G276800 Sobic001G294150--Sobic010G276800 Sobic007G161800 Sobic007G161800 Sobic001G294150--Sobic007G161800 Sobic010G001600 Sobic010G001600 Sobic001G294150--Sobic010G001600 Sobic001G294150--Sobic001G292200 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic001G294150--Sobic001G543800 Sobic001G294150--Sobic007G021400 Sobic001G294150--Sobic001G474600 Sobic009G008400--Sobic010G112000 Sobic001G178700 Sobic001G178700 Sobic009G008400--Sobic001G178700 Sobic009G008400--Sobic007G161800 Sobic006G131500 Sobic006G131500 Sobic009G008400--Sobic006G131500 Sobic001G016600 Sobic001G016600 Sobic009G008400--Sobic001G016600 Sobic001G280900 Sobic001G280900 Sobic009G008400--Sobic001G280900 Sobic009G008400--Sobic001G498600 Sobic001G235900 Sobic001G235900 Sobic009G008400--Sobic001G235900 Sobic001G248300 Sobic001G248300 Sobic009G008400--Sobic001G248300 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic007G116200--Sobic006G216800 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic007G116200--Sobic010G010700 Sobic007G116200--Sobic002G134200 Sobic007G116200--Sobic006G182900 Sobic004G359800 Sobic004G359800 Sobic007G116200--Sobic004G359800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic007G116200--Sobic010G139000 Sobic007G116200--Sobic010G256700 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic007G116200--Sobic004G209600 Sobic007G116200--Sobic003G280800 Sobic009G132100 Sobic009G132100 Sobic003G182600--Sobic009G132100 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic003G182600--Sobic008G001200 Sobic003G182600--Sobic007G116200 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic003G182600--Sobic003G155100 Sobic001G375100 Sobic001G375100 Sobic003G182600--Sobic001G375100 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G182600--Sobic001G527800 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic003G182600--Sobic002G345700 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G182600--Sobic001G194200 Sobic003G205200 Sobic003G205200 Sobic003G182600--Sobic003G205200 Sobic010G256700--Sobic007G116200 Sobic003G396200 Sobic003G396200 Sobic010G256700--Sobic003G396200 Sobic010G256700--Sobic006G182900 Sobic001G159400 Sobic001G159400 Sobic010G256700--Sobic001G159400 Sobic010G248700 Sobic010G248700 Sobic010G256700--Sobic010G248700 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic010G256700--Sobic007G193700 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic010G256700--Sobic006G133900 Sobic001G454500 Sobic001G454500 Sobic010G256700--Sobic001G454500 Sobic002G104100 Sobic002G104100 Sobic010G256700--Sobic002G104100
Octagon: transcription factors


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