Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G021600.1
Synonym Sb07g001890
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt C5YMF8
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17080 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43960.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030228 , Zm00025a030229 , Zm00025a030227 , Zm00025a005660 , Zm00025a005657 , Zm00025a005656 , Zm00025a030230
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G021500 carrier, putative, expressed -
2 Sobic.007G001200 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08515: vesicle-associated membrane protein 7
3 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
4 Sobic.007G001500 nicalin, putative, expressed -
5 Sobic.005G044800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
7 Sobic.002G192200 proteasome subunit, putative, expressed -
8 Sobic.005G086100 glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed K01800: maiA, maleylacetoacetate isomerase
9 Sobic.002G400101 - -
10 Sobic.002G122200 - -
11 Sobic.002G113100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G348300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K06269: serine/threonine-protein phosphatase PP1 catalytic subunit
13 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
14 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase
15 Sobic.001G105700 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G165600 aminopeptidase, putative, expressed K01256: aminopeptidase N
17 Sobic.003G127001 - -
18 Sobic.004G092900 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
19 Sobic.004G285200 expressed protein -
20 Sobic.003G241500 dehydrogenase, putative, expressed K00031: IDH1, IDH2, isocitrate dehydrogenase


Gene co-expression network
sample Sobic007G021600 Sobic007G021600 Sobic007G021500 Sobic007G021500 Sobic007G021600--Sobic007G021500 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic007G021600--Sobic007G001200 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic007G021600--Sobic005G095660 Sobic007G001500 Sobic007G001500 Sobic007G021600--Sobic007G001500 Sobic005G044800 Sobic005G044800 Sobic007G021600--Sobic005G044800 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic007G021600--Sobic001G333300 Sobic002G192200 Sobic002G192200 Sobic007G021600--Sobic002G192200 Sobic005G086100 Sobic005G086100 Sobic007G021600--Sobic005G086100 Sobic002G400101 Sobic002G400101 Sobic007G021600--Sobic002G400101 Sobic007G021500--Sobic007G021600 Sobic001G105700 Sobic001G105700 Sobic007G021500--Sobic001G105700 Sobic007G021500--Sobic007G001500 Sobic006G049600 Sobic006G049600 Sobic007G021500--Sobic006G049600 Sobic004G005100 Sobic004G005100 Sobic007G021500--Sobic004G005100 Sobic006G268600 Sobic006G268600 Sobic007G021500--Sobic006G268600 Sobic010G228500 Sobic010G228500 Sobic007G021500--Sobic010G228500 Sobic003G241500 Sobic003G241500 Sobic007G021500--Sobic003G241500 Sobic009G057300 Sobic009G057300 Sobic007G021500--Sobic009G057300 Sobic007G001200--Sobic001G333300 Sobic007G001200--Sobic007G001500 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic007G001200--Sobic003G317500 Sobic010G147000 Sobic010G147000 Sobic007G001200--Sobic010G147000 Sobic007G165600 Sobic007G165600 Sobic007G001200--Sobic007G165600 Sobic009G056200 Sobic009G056200 Sobic007G001200--Sobic009G056200 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic007G001200--Sobic006G072601 Sobic009G222500 Sobic009G222500 Sobic007G001200--Sobic009G222500 Sobic010G139600 Sobic010G139600 Sobic007G001200--Sobic010G139600 Sobic002G122200 Sobic002G122200 Sobic005G095660--Sobic002G122200 Sobic001G248200 Sobic001G248200 Sobic005G095660--Sobic001G248200 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic005G095660--Sobic010G057633 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic005G095660--Sobic002G249300 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic005G095660--Sobic001G000300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G095660--Sobic007G010700 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic005G095660--Sobic001G459600 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic005G095660--Sobic003G174400 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic005G095660--Sobic008G081800 Sobic007G001500--Sobic007G001200 Sobic002G308500 Sobic002G308500 Sobic007G001500--Sobic002G308500 Sobic005G003300 Sobic005G003300 Sobic007G001500--Sobic005G003300 Sobic003G279900 Sobic003G279900 Sobic007G001500--Sobic003G279900 Sobic005G034300 Sobic005G034300 Sobic007G001500--Sobic005G034300 Sobic006G103200 Sobic006G103200 Sobic007G001500--Sobic006G103200 Sobic007G001500--Sobic001G105700 Sobic009G201700 Sobic009G201700 Sobic007G001500--Sobic009G201700 Sobic008G124800 Sobic008G124800 Sobic007G001500--Sobic008G124800 Sobic004G358600 Sobic004G358600 Sobic005G044800--Sobic004G358600 Sobic003G012200 Sobic003G012200 Sobic005G044800--Sobic003G012200 Sobic003G372000 Sobic003G372000 Sobic005G044800--Sobic003G372000 Sobic006G244700 Sobic006G244700 Sobic005G044800--Sobic006G244700 Sobic003G344900 Sobic003G344900 Sobic005G044800--Sobic003G344900 Sobic004G127700 Sobic004G127700 Sobic005G044800--Sobic004G127700 Sobic002G116900 Sobic002G116900 Sobic005G044800--Sobic002G116900 Sobic003G273600 Sobic003G273600 Sobic005G044800--Sobic003G273600 Sobic003G055700 Sobic003G055700 Sobic005G044800--Sobic003G055700 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic006G101700 Sobic006G101700 Sobic002G192200--Sobic006G101700 Sobic010G027600 Sobic010G027600 Sobic002G192200--Sobic010G027600 Sobic002G192200--Sobic009G222500 Sobic004G066200 Sobic004G066200 Sobic002G192200--Sobic004G066200 Sobic007G166400 Sobic007G166400 Sobic002G192200--Sobic007G166400 Sobic001G114500 Sobic001G114500 Sobic002G192200--Sobic001G114500 Sobic001G522600 Sobic001G522600 Sobic002G192200--Sobic001G522600 Sobic006G049700 Sobic006G049700 Sobic002G192200--Sobic006G049700 Sobic007G225100 Sobic007G225100 Sobic002G192200--Sobic007G225100 Sobic002G113100 Sobic002G113100 Sobic005G086100--Sobic002G113100 Sobic007G068900 Sobic007G068900 Sobic005G086100--Sobic007G068900 Sobic009G210600 Sobic009G210600 Sobic005G086100--Sobic009G210600 Sobic007G007000 Sobic007G007000 Sobic005G086100--Sobic007G007000 Sobic003G354400 Sobic003G354400 Sobic005G086100--Sobic003G354400 Sobic005G086100--Sobic005G044800 Sobic006G049300 Sobic006G049300 Sobic005G086100--Sobic006G049300 Sobic001G508100 Sobic001G508100 Sobic005G086100--Sobic001G508100 Sobic009G217100 Sobic009G217100 Sobic005G086100--Sobic009G217100 Sobic002G400101--Sobic007G165600 Sobic001G146800 Sobic001G146800 Sobic002G400101--Sobic001G146800 Sobic001G120500 Sobic001G120500 Sobic002G400101--Sobic001G120500 Sobic002G380200 Sobic002G380200 Sobic002G400101--Sobic002G380200 Sobic006G153900 Sobic006G153900 Sobic002G400101--Sobic006G153900 Sobic009G101200 Sobic009G101200 Sobic002G400101--Sobic009G101200 Sobic002G400101--Sobic009G056200 Sobic002G425700 Sobic002G425700 Sobic002G400101--Sobic002G425700 Sobic002G260900 Sobic002G260900 Sobic002G400101--Sobic002G260900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.