Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G097800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGU1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g16810.1 : retrotransposon protein, putative, SINE subclass, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054612
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G001800 expressed protein -
2 Sobic.001G344400 3-oxoacyl-synthase, putative, expressed K09458: fabF, OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II
3 Sobic.003G326700 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
4 Sobic.004G296500 serine esterase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G194000 expressed protein -
6 Sobic.006G145600 Os4bglu16 - monolignol beta-glucoside homologue, expressed K05350: beta-glucosidase
7 Sobic.002G278900 - -
8 Sobic.001G066400 - -
9 Sobic.003G118800 - -
10 Sobic.001G050300 LTPL83 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.008G057500 Aldehyde dehydrogenase 3 H1(PubMedID : 26320239)@aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
12 Sobic.008G018700 expressed protein -
13 Sobic.008G105300 expressed protein -
14 Sobic.001G269000 lysosomal alpha-mannosidase precursor, putative, expressed K01191: alpha-mannosidase
15 Sobic.006G037401 - -
16 Sobic.005G125400 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
17 Sobic.006G000900 formin-like protein 3 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G090400 OsRR1 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
19 Sobic.009G218900 CPuORF26 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K05929: E2.1.1.103, phosphoethanolamine N-methyltransferase
20 Sobic.005G080025 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G097800 Sobic007G097800 Sobic009G001800 Sobic009G001800 Sobic007G097800--Sobic009G001800 Sobic001G344400 Sobic001G344400 Sobic007G097800--Sobic001G344400 Sobic003G326700 Sobic003G326700 Sobic007G097800--Sobic003G326700 Sobic004G296500 Sobic004G296500 Sobic007G097800--Sobic004G296500 Sobic004G194000 Sobic004G194000 Sobic007G097800--Sobic004G194000 Sobic006G145600 Sobic006G145600 Sobic007G097800--Sobic006G145600 Sobic002G278900 Sobic002G278900 Sobic007G097800--Sobic002G278900 Sobic001G066400 Sobic001G066400 Sobic007G097800--Sobic001G066400 Sobic003G118800 Sobic003G118800 Sobic007G097800--Sobic003G118800 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic009G001800--Sobic008G105300 Sobic009G001800--Sobic004G296500 Sobic009G001800--Sobic003G118800 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic009G001800--Sobic004G143400 Sobic003G069700 Sobic003G069700 Sobic009G001800--Sobic003G069700 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic009G001800--Sobic001G495300 Sobic007G210600 Sobic007G210600 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Octagon: transcription factors


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