Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G109600.1
Synonym RTFL17, DVL4
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PHF8
Pfam PF08137
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13245 : ROTUNDIFOLIA like 17
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G183900 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.004G248500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.006G028400 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 2, putative, expressed -
4 Sobic.005G097600 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
5 Sobic.001G212451 - -
6 Sobic.002G365500 igA FC receptor precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G365600 igA FC receptor precursor, putative, expressed -
8 Sobic.008G034700 phytosulfokines precursor, putative, expressed -
9 Sobic.003G269600 "CYP711A family, the cytochrome P450 homepage. Catalyzed the conversion of carlactone (CL) to carlactonoic acid (CLA)."(PubMedID : 33793911)@Synthesized carlactonoic acid (CLA) from carlactone (CL).(PubMedID : 34970291)@cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.010G271200 expressed protein -
11 Sobic.003G287200 WRKY23, expressed -
12 Sobic.001G263300 glycosyltransferase, putative, expressed K18207: POMGNT2, protein O-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
13 Sobic.010G106500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
14 Sobic.004G110700 DNA binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G240400 leaf senescence related protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G365550 - -
17 Sobic.007G090472 - -
18 Sobic.009G122300 white-brown complex homolog protein 16, putative, expressed -
19 Sobic.001G464300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G096400 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G109600 Sobic007G109600 Sobic006G183900 Sobic006G183900 Sobic007G109600--Sobic006G183900 Sobic004G248500 Sobic004G248500 Sobic007G109600--Sobic004G248500 Sobic006G028400 Sobic006G028400 Sobic007G109600--Sobic006G028400 Sobic005G097600 Sobic005G097600 Sobic007G109600--Sobic005G097600 Sobic001G212451 Sobic001G212451 Sobic007G109600--Sobic001G212451 Sobic002G365500 Sobic002G365500 Sobic007G109600--Sobic002G365500 Sobic002G365600 Sobic002G365600 Sobic007G109600--Sobic002G365600 Sobic008G034700 Sobic008G034700 Sobic007G109600--Sobic008G034700 Sobic003G269600 Sobic003G269600 Sobic007G109600--Sobic003G269600 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic006G183900--Sobic003G287200 Sobic006G183900--Sobic007G109600 Sobic006G183900--Sobic006G028400 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic006G183900--Sobic007G090472 Sobic006G183900--Sobic008G034700 Sobic006G183900--Sobic004G248500 Sobic007G170300 Sobic007G170300 Sobic006G183900--Sobic007G170300 Sobic006G183900--Sobic002G365600 Sobic006G183900--Sobic002G365500 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic004G248500--Sobic005G115300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic004G248500--Sobic001G503000 Sobic001G464300 Sobic001G464300 Sobic004G248500--Sobic001G464300 Sobic004G248500--Sobic007G109600 Sobic004G312200 Sobic004G312200 Sobic004G248500--Sobic004G312200 Sobic001G348800 Sobic001G348800 Sobic004G248500--Sobic001G348800 Sobic004G248500--Sobic006G183900 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic004G248500--Sobic005G104200 Sobic001G263300 Sobic001G263300 Sobic004G248500--Sobic001G263300 Sobic006G028400--Sobic006G183900 Sobic003G203600 Sobic003G203600 Sobic006G028400--Sobic003G203600 Sobic006G028400--Sobic007G170300 Sobic006G028400--Sobic007G109600 Sobic007G178900 Sobic007G178900 Sobic006G028400--Sobic007G178900 Sobic002G185800 Sobic002G185800 Sobic006G028400--Sobic002G185800 Sobic006G028400--Sobic002G365500 Sobic004G071000 Sobic004G071000 Sobic006G028400--Sobic004G071000 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic006G028400--Sobic002G365550 Sobic005G097600--Sobic001G263300 Sobic002G003700 Sobic002G003700 Sobic005G097600--Sobic002G003700 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic005G097600--Sobic002G115600 Sobic004G351200 Sobic004G351200 Sobic005G097600--Sobic004G351200 Sobic010G158400 Sobic010G158400 Sobic005G097600--Sobic010G158400 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic005G097600--Sobic003G240400 Sobic005G175900 Sobic005G175900 Sobic005G097600--Sobic005G175900 Sobic005G097600--Sobic004G248500 Sobic002G118900 Sobic002G118900 Sobic005G097600--Sobic002G118900 Sobic001G212451--Sobic001G464300 Sobic001G212451--Sobic004G248500 Sobic002G391200 Sobic002G391200 Sobic001G212451--Sobic002G391200 Sobic010G021700 Sobic010G021700 Sobic001G212451--Sobic010G021700 Sobic001G212451--Sobic005G097600 Sobic001G212451--Sobic007G109600 Sobic002G307900 Sobic002G307900 Sobic001G212451--Sobic002G307900 Sobic005G036900 Sobic005G036900 Sobic001G212451--Sobic005G036900 Sobic001G301400 Sobic001G301400 Sobic001G212451--Sobic001G301400 Sobic002G365500--Sobic002G365550 Sobic002G365500--Sobic002G365600 Sobic010G115700 Sobic010G115700 Sobic002G365500--Sobic010G115700 Sobic002G365801 Sobic002G365801 Sobic002G365500--Sobic002G365801 Sobic002G365500--Sobic004G071000 Sobic002G368300 Sobic002G368300 Sobic002G365500--Sobic002G368300 Sobic002G365500--Sobic006G183900 Sobic002G365500--Sobic006G028400 Sobic003G269500 Sobic003G269500 Sobic002G365500--Sobic003G269500 Sobic002G365600--Sobic002G365550 Sobic002G365600--Sobic003G269500 Sobic002G365600--Sobic002G365500 Sobic008G172500 Sobic008G172500 Sobic002G365600--Sobic008G172500 Sobic002G365600--Sobic006G183900 Sobic002G365600--Sobic004G071000 Sobic002G365600--Sobic002G365801 Sobic001G364400 Sobic001G364400 Sobic002G365600--Sobic001G364400 Sobic010G212500 Sobic010G212500 Sobic002G365600--Sobic010G212500 Sobic008G034700--Sobic006G183900 Sobic008G034700--Sobic007G109600 Sobic008G034700--Sobic002G365600 Sobic008G048400 Sobic008G048400 Sobic008G034700--Sobic008G048400 Sobic008G034700--Sobic003G269500 Sobic005G041300 Sobic005G041300 Sobic008G034700--Sobic005G041300 Sobic009G073800 Sobic009G073800 Sobic008G034700--Sobic009G073800 Sobic004G126700 Sobic004G126700 Sobic008G034700--Sobic004G126700 Sobic008G034700--Sobic002G365500 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic003G269600--Sobic004G110700 Sobic003G399600 Sobic003G399600 Sobic003G269600--Sobic003G399600 Sobic006G274933 Sobic006G274933 Sobic003G269600--Sobic006G274933 Sobic006G150100 Sobic006G150100 Sobic003G269600--Sobic006G150100 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic003G269600--Sobic002G183700 Sobic010G106500 Sobic010G106500 Sobic003G269600--Sobic010G106500 Sobic003G121100 Sobic003G121100 Sobic003G269600--Sobic003G121100 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic003G269600--Sobic003G140700 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic003G269600--Sobic006G170600
Octagon: transcription factors


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