Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G010300.1
Synonym Sb08g000970
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQ73
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g14310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G120550 - K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.005G019750 - -
3 Sobic.010G028900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
4 Sobic.010G052900 expressed protein -
5 Sobic.002G421350 - -
6 Sobic.009G107140 - -
7 Sobic.004G062200 expressed protein -
8 Sobic.004G154100 OsFBX346 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G368100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@COBRA, putative, expressed -
10 Sobic.005G074300 - -
11 Sobic.009G157800 transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G138000 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G267100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.003G392275 - -
15 Sobic.006G171600 ZOS4-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
16 Sobic.004G074900 serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B subunitbeta, putative, expressed K11583: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B''
17 Sobic.005G099100 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
18 Sobic.008G057600 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G197900 expressed protein -
20 Sobic.002G304801 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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