Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G029600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBF1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G153400 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
2 Sobic.008G007700 expressed protein -
3 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
4 Sobic.002G377900 mitosis protein dim1, putative, expressed -
5 Sobic.002G304700 RFT1, putative, expressed K06316: oligosaccharide translocation protein RFT1
6 Sobic.008G116700 expressed protein -
7 Sobic.008G054700 growth regulator related protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G065201 - -
9 Sobic.004G107100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CID11, putative, expressed -
10 Sobic.003G214850 - -
11 Sobic.008G124600 expressed protein -
12 Sobic.003G433400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
13 Sobic.001G280500 abscisic acid insensitive 8, putative, expressed -
14 Sobic.002G239400 OsFBX338 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G252200 expressed protein K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
16 Sobic.009G046900 N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.003G004800 ATP binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G063200 expressed protein -
19 Sobic.006G232800 expressed protein K17785: IMMT, FCJ1, mitofilin
20 Sobic.010G182000 26S protease regulatory subunit, putative, expressed K03066: PSMC5, 26S proteasome regulatory subunit T6


Gene co-expression network
sample Sobic008G029600 Sobic008G029600 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic008G029600--Sobic010G153400 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic008G029600--Sobic008G007700 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic008G029600--Sobic001G539400 Sobic002G377900 Sobic002G377900 Sobic008G029600--Sobic002G377900 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic008G029600--Sobic002G304700 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic008G029600--Sobic008G116700 Sobic008G054700 Sobic008G054700 Sobic008G029600--Sobic008G054700 Sobic003G065201 Sobic003G065201 Sobic008G029600--Sobic003G065201 Sobic004G107100 Sobic004G107100 Sobic008G029600--Sobic004G107100 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic010G153400--Sobic002G348400 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic010G153400--Sobic003G004800 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic010G153400--Sobic002G392400 Sobic008G022400 Sobic008G022400 Sobic010G153400--Sobic008G022400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic010G153400--Sobic001G131900 Sobic003G293400 Sobic003G293400 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Octagon: transcription factors


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