Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G031700.1
Synonym RHA3B
Functional annotation RING-H2 finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PB17
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155
NCBI CDD KOG1493; Anaphase-promoting complex (APC), subunit 11
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35480 : RING-H2 finger A3B
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46100.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G031700 Sobic008G031700 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic008G031700--Sobic005G201900 Sobic003G429401 Sobic003G429401 Sobic008G031700--Sobic003G429401 Sobic006G015900 Sobic006G015900 Sobic008G031700--Sobic006G015900 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic008G031700--Sobic004G215000 Sobic002G158000 Sobic002G158000 Sobic008G031700--Sobic002G158000 Sobic008G110400 Sobic008G110400 Sobic008G031700--Sobic008G110400 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic008G031700--Sobic004G227900 Sobic006G219100 Sobic006G219100 Sobic008G031700--Sobic006G219100 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic008G031700--Sobic005G089700 Sobic005G201900--Sobic005G089700 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic005G201900--Sobic001G334501 Sobic001G459700 Sobic001G459700 Sobic005G201900--Sobic001G459700 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic005G201900--Sobic008G032400 Sobic001G133200 Sobic001G133200 Sobic005G201900--Sobic001G133200 Sobic002G428000 Sobic002G428000 Sobic003G429401--Sobic002G428000 Sobic003G429401--Sobic008G110400 Sobic003G287000 Sobic003G287000 Sobic003G429401--Sobic003G287000 Sobic003G429401--Sobic008G031700 Sobic007G195300 Sobic007G195300 Sobic003G429401--Sobic007G195300 Sobic010G165100 Sobic010G165100 Sobic003G429401--Sobic010G165100 Sobic002G278800 Sobic002G278800 Sobic003G429401--Sobic002G278800 Sobic009G216300 Sobic009G216300 Sobic003G429401--Sobic009G216300 Sobic002G278700 Sobic002G278700 Sobic003G429401--Sobic002G278700 Sobic006G015900--Sobic006G219100 Sobic006G015900--Sobic004G227900 Sobic006G015900--Sobic004G215000 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic006G015900--Sobic010G027700 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic006G015900--Sobic007G094200 Sobic004G045500 Sobic004G045500 Sobic006G015900--Sobic004G045500 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic006G015900--Sobic008G004200 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic006G015900--Sobic004G342000 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic006G015900--Sobic001G179400 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic002G139800 Sobic002G139800 Sobic002G158000--Sobic002G139800 Sobic002G158000--Sobic005G201900 Sobic002G158000--Sobic004G215000 Sobic002G158000--Sobic001G438500 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic002G158000--Sobic002G023700 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic002G158000--Sobic004G062100 Sobic005G042200 Sobic005G042200 Sobic002G158000--Sobic005G042200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic002G158000--Sobic009G254500 Sobic002G158000--Sobic004G227900 Sobic008G110400--Sobic006G219100 Sobic002G382500 Sobic002G382500 Sobic008G110400--Sobic002G382500 Sobic008G110400--Sobic002G068400 Sobic003G041801 Sobic003G041801 Sobic008G110400--Sobic003G041801 Sobic002G403000 Sobic002G403000 Sobic008G110400--Sobic002G403000 Sobic008G110400--Sobic006G015900 Sobic008G110400--Sobic010G027700 Sobic008G110400--Sobic004G215000 Sobic008G110400--Sobic001G179400 Sobic004G227900--Sobic008G004200 Sobic004G227900--Sobic001G334501 Sobic010G053300 Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic005G089700 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic004G227900--Sobic007G000600 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic004G227900--Sobic001G366000 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic004G227900--Sobic005G200700 Sobic003G016000 Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic008G032400 Sobic006G219100--Sobic007G094200 Sobic006G219100--Sobic004G215000 Sobic006G219100--Sobic001G179400 Sobic006G219100--Sobic004G227900 Sobic008G154700 Sobic008G154700 Sobic006G219100--Sobic008G154700 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic006G219100--Sobic003G116100 Sobic006G219100--Sobic010G027700 Sobic006G219100--Sobic002G068400 Sobic006G219100--Sobic004G342000 Sobic005G089700--Sobic001G133200
Octagon: transcription factors


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