Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G107600.1
Synonym Sb08g016250
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PCY7
Pfam -
Panther DB PTHR33133 PTHR33133:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G61340 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g32260.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040667
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G028310.1 , HORVU5Hr1G028310.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G184500 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
2 Sobic.010G104400 cysteine-rich repeat secretory protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.009G078900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.001G399400 calmodulin binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G137000 RALFL42 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
6 Sobic.001G403200 receptor-like kinase RHG1, putative, expressed -
7 Sobic.004G077100 Mad3/BUB1 homology region 1 domain containing protein, expressed K02178: checkpoint serine/threonine-protein kinase
8 Sobic.002G184800 expressed protein -
9 Sobic.004G323100 SCP-like extracellular protein, expressed -
10 Sobic.002G020500 ternary complex factor MIP1, putative, expressed -
11 Sobic.001G451800 atypical receptor-like kinase MARK, putative, expressed -
12 Sobic.003G041700 DNA mismatch repair protein MSH6-2, putative, expressed K08737: DNA mismatch repair protein MSH6
13 Sobic.003G151900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.001G038400 expressed protein -
15 Sobic.001G430000 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
16 Sobic.003G399400 expressed protein -
17 Sobic.002G359800 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G004500 expressed protein -
19 Sobic.006G271100 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G049800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic008G107600 Sobic008G107600 Sobic003G184500 Sobic003G184500 Sobic008G107600--Sobic003G184500 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic008G107600--Sobic010G104400 Sobic009G078900 Sobic009G078900 Sobic008G107600--Sobic009G078900 Sobic001G399400 Sobic001G399400 Sobic008G107600--Sobic001G399400 Sobic008G137000 Sobic008G137000 Sobic008G107600--Sobic008G137000 Sobic001G403200 Sobic001G403200 Sobic008G107600--Sobic001G403200 Sobic004G077100 Sobic004G077100 Sobic008G107600--Sobic004G077100 Sobic002G184800 Sobic002G184800 Sobic008G107600--Sobic002G184800 Sobic004G323100 Sobic004G323100 Sobic008G107600--Sobic004G323100 Sobic001G430000 Sobic001G430000 Sobic003G184500--Sobic001G430000 Sobic003G184500--Sobic001G399400 Sobic003G184500--Sobic008G107600 Sobic006G271100 Sobic006G271100 Sobic003G184500--Sobic006G271100 Sobic002G359800 Sobic002G359800 Sobic003G184500--Sobic002G359800 Sobic003G184500--Sobic002G184800 Sobic003G399400 Sobic003G399400 Sobic003G184500--Sobic003G399400 Sobic002G219500 Sobic002G219500 Sobic003G184500--Sobic002G219500 Sobic003G023666 Sobic003G023666 Sobic003G184500--Sobic003G023666 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic010G104400--Sobic002G016400 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic010G104400--Sobic003G296500 Sobic006G149300 Sobic006G149300 Sobic010G104400--Sobic006G149300 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic010G104400--Sobic007G208100 Sobic001G177900 Sobic001G177900 Sobic010G104400--Sobic001G177900 Sobic002G020500 Sobic002G020500 Sobic010G104400--Sobic002G020500 Sobic004G233700 Sobic004G233700 Sobic010G104400--Sobic004G233700 Sobic010G104400--Sobic001G403200 Sobic004G287700 Sobic004G287700 Sobic010G104400--Sobic004G287700 Sobic009G078900--Sobic008G137000 Sobic009G078900--Sobic010G104400 Sobic001G451800 Sobic001G451800 Sobic009G078900--Sobic001G451800 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic009G078900--Sobic001G406700 Sobic009G078900--Sobic008G107600 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic009G078900--Sobic003G420100 Sobic001G399200 Sobic001G399200 Sobic009G078900--Sobic001G399200 Sobic003G270400 Sobic003G270400 Sobic009G078900--Sobic003G270400 Sobic003G132500 Sobic003G132500 Sobic009G078900--Sobic003G132500 Sobic001G399400--Sobic002G219500 Sobic001G399400--Sobic006G271100 Sobic001G399400--Sobic003G184500 Sobic009G070000 Sobic009G070000 Sobic001G399400--Sobic009G070000 Sobic006G228100 Sobic006G228100 Sobic001G399400--Sobic006G228100 Sobic001G399400--Sobic003G399400 Sobic002G004500 Sobic002G004500 Sobic001G399400--Sobic002G004500 Sobic005G188400 Sobic005G188400 Sobic001G399400--Sobic005G188400 Sobic001G399400--Sobic004G077100 Sobic005G229100 Sobic005G229100 Sobic008G137000--Sobic005G229100 Sobic008G137000--Sobic001G406700 Sobic008G137000--Sobic009G078900 Sobic006G144600 Sobic006G144600 Sobic008G137000--Sobic006G144600 Sobic009G162700 Sobic009G162700 Sobic008G137000--Sobic009G162700 Sobic008G137000--Sobic001G399200 Sobic003G387500 Sobic003G387500 Sobic008G137000--Sobic003G387500 Sobic008G137000--Sobic008G107600 Sobic001G362100 Sobic001G362100 Sobic008G137000--Sobic001G362100 Sobic001G403200--Sobic002G020500 Sobic004G271500 Sobic004G271500 Sobic001G403200--Sobic004G271500 Sobic003G041700 Sobic003G041700 Sobic001G403200--Sobic003G041700 Sobic001G403200--Sobic010G104400 Sobic008G113800 Sobic008G113800 Sobic001G403200--Sobic008G113800 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic001G403200--Sobic003G151900 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic001G403200--Sobic001G314000 Sobic001G038400 Sobic001G038400 Sobic001G403200--Sobic001G038400 Sobic006G009500 Sobic006G009500 Sobic001G403200--Sobic006G009500 Sobic001G075400 Sobic001G075400 Sobic004G077100--Sobic001G075400 Sobic009G233500 Sobic009G233500 Sobic004G077100--Sobic009G233500 Sobic006G069500 Sobic006G069500 Sobic004G077100--Sobic006G069500 Sobic004G180400 Sobic004G180400 Sobic004G077100--Sobic004G180400 Sobic004G077100--Sobic003G041700 Sobic005G016300 Sobic005G016300 Sobic004G077100--Sobic005G016300 Sobic003G273800 Sobic003G273800 Sobic004G077100--Sobic003G273800 Sobic004G077100--Sobic010G104400 Sobic006G214000 Sobic006G214000 Sobic004G077100--Sobic006G214000 Sobic002G184800--Sobic002G359800 Sobic002G184800--Sobic001G038400 Sobic002G184800--Sobic001G430000 Sobic010G260600 Sobic010G260600 Sobic002G184800--Sobic010G260600 Sobic002G184800--Sobic003G184500 Sobic009G165300 Sobic009G165300 Sobic002G184800--Sobic009G165300 Sobic002G184800--Sobic001G403200 Sobic004G129700 Sobic004G129700 Sobic002G184800--Sobic004G129700 Sobic010G036200 Sobic010G036200 Sobic002G184800--Sobic010G036200 Sobic004G323100--Sobic001G403200 Sobic004G323100--Sobic004G077100 Sobic004G025200 Sobic004G025200 Sobic004G323100--Sobic004G025200 Sobic004G323100--Sobic008G107600 Sobic004G323100--Sobic003G151900 Sobic004G323100--Sobic004G129700 Sobic004G323100--Sobic001G038400 Sobic004G323100--Sobic003G041700 Sobic004G323100--Sobic003G184500
Octagon: transcription factors


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