Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G135200.1
Synonym Sb08g018670
Functional annotation importin subunit beta, putative, expressed
UniProt C5YPY1
Pfam PF13513 PF03810
Panther DB PTHR10527:SF19 PTHR10527
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14293; KPNB1, importin subunit beta-1
Gene Ontology GO:0006886; intracellular protein transport GO:0008536Ran GTPase binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53480 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38110.1 : importin subunit beta, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004226 , Zm00025a025410
Brachypodium KQK17605
Barley HORVU5Hr1G021530.2 , HORVU5Hr1G021530.3 , HORVU5Hr1G021530.1 , HORVU5Hr1G021530.4 , HORVU5Hr1G021580.1
Wheat TraesCS5A02G082600 , TraesCS5A02G077200 , TraesCS5D02G095100 , TraesCS5D02G094600 , TraesCS5B02G088700 , TraesCS5B02G088400 , TraesCS5B02G088400
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G020700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14018: PLAA, DOA1, phospholipase A-2-activating protein
2 Sobic.009G045900 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01892: HARS, histidyl-tRNA synthetase
3 Sobic.006G073200 OTU-like cysteine protease family protein, putative, expressed K12655: OTUD5, OTU domain-containing protein 5
4 Sobic.008G157200 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
5 Sobic.002G350600 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G251100 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed K12603: CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6
7 Sobic.003G029600 coatomer alpha subunit, putative, expressed K05236: COPA, coatomer subunit alpha
8 Sobic.008G033500 nucleolar GTPase, putative, expressed -
9 Sobic.007G054800 valyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01873: VARS, valyl-tRNA synthetase
10 Sobic.008G085700 exocyst complex component 5, putative, expressed -
11 Sobic.004G131300 expressed protein K12617: PATL1, DNA topoisomerase 2-associated protein PAT1
12 Sobic.001G404600 expressed protein K18270: Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit
13 Sobic.003G104000 expressed protein K15133: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
14 Sobic.004G257100 transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed -
15 Sobic.008G082500 alanyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01872: AARS, alanyl-tRNA synthetase
16 Sobic.003G314700 expressed protein -
17 Sobic.003G099300 expressed protein K18749: LSM14, RAP55, protein LSM14
18 Sobic.006G280000 transportin-2, putative, expressed K18752: TNPO1, IPO2, transportin-1
19 Sobic.002G246700 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
20 Sobic.001G117800 coatomer alpha subunit, putative, expressed K05236: COPA, coatomer subunit alpha


Gene co-expression network
sample Sobic008G135200 Sobic008G135200 Sobic002G020700 Sobic002G020700 Sobic008G135200--Sobic002G020700 Sobic009G045900 Sobic009G045900 Sobic008G135200--Sobic009G045900 Sobic006G073200 Sobic006G073200 Sobic008G135200--Sobic006G073200 Sobic008G157200 Sobic008G157200 Sobic008G135200--Sobic008G157200 Sobic002G350600 Sobic002G350600 Sobic008G135200--Sobic002G350600 Sobic001G251100 Sobic001G251100 Sobic008G135200--Sobic001G251100 Sobic003G029600 Sobic003G029600 Sobic008G135200--Sobic003G029600 Sobic008G033500 Sobic008G033500 Sobic008G135200--Sobic008G033500 Sobic007G054800 Sobic007G054800 Sobic008G135200--Sobic007G054800 Sobic010G020400 Sobic010G020400 Sobic002G020700--Sobic010G020400 Sobic008G085700 Sobic008G085700 Sobic002G020700--Sobic008G085700 Sobic008G055900 Sobic008G055900 Sobic002G020700--Sobic008G055900 Sobic001G333100 Sobic001G333100 Sobic002G020700--Sobic001G333100 Sobic010G223300 Sobic010G223300 Sobic002G020700--Sobic010G223300 Sobic001G449900 Sobic001G449900 Sobic002G020700--Sobic001G449900 Sobic004G039600 Sobic004G039600 Sobic002G020700--Sobic004G039600 Sobic008G082500 Sobic008G082500 Sobic002G020700--Sobic008G082500 Sobic002G020700--Sobic007G054800 Sobic009G045900--Sobic008G135200 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic009G045900--Sobic002G047000 Sobic002G246700 Sobic002G246700 Sobic009G045900--Sobic002G246700 Sobic002G408900 Sobic002G408900 Sobic009G045900--Sobic002G408900 Sobic001G090100 Sobic001G090100 Sobic009G045900--Sobic001G090100 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic009G045900--Sobic003G314700 Sobic010G206300 Sobic010G206300 Sobic009G045900--Sobic010G206300 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic009G045900--Sobic001G248100 Sobic001G537500 Sobic001G537500 Sobic009G045900--Sobic001G537500 Sobic006G073200--Sobic008G157200 Sobic004G257100 Sobic004G257100 Sobic006G073200--Sobic004G257100 Sobic001G431000 Sobic001G431000 Sobic006G073200--Sobic001G431000 Sobic006G073200--Sobic001G537500 Sobic001G493200 Sobic001G493200 Sobic006G073200--Sobic001G493200 Sobic006G073200--Sobic008G135200 Sobic006G036100 Sobic006G036100 Sobic006G073200--Sobic006G036100 Sobic004G131300 Sobic004G131300 Sobic006G073200--Sobic004G131300 Sobic006G073200--Sobic001G251100 Sobic008G157200--Sobic006G073200 Sobic006G127600 Sobic006G127600 Sobic008G157200--Sobic006G127600 Sobic008G157200--Sobic004G131300 Sobic009G084900 Sobic009G084900 Sobic008G157200--Sobic009G084900 Sobic008G157200--Sobic003G314700 Sobic007G162100 Sobic007G162100 Sobic008G157200--Sobic007G162100 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic008G157200--Sobic003G405500 Sobic008G157200--Sobic001G248100 Sobic001G404600 Sobic001G404600 Sobic008G157200--Sobic001G404600 Sobic006G280000 Sobic006G280000 Sobic002G350600--Sobic006G280000 Sobic002G350600--Sobic008G135200 Sobic002G350600--Sobic001G251100 Sobic002G350600--Sobic007G054800 Sobic003G104000 Sobic003G104000 Sobic002G350600--Sobic003G104000 Sobic004G040900 Sobic004G040900 Sobic002G350600--Sobic004G040900 Sobic001G312900 Sobic001G312900 Sobic002G350600--Sobic001G312900 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic002G350600--Sobic002G294800 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic002G350600--Sobic001G362200 Sobic001G251100--Sobic003G104000 Sobic002G256700 Sobic002G256700 Sobic001G251100--Sobic002G256700 Sobic001G251100--Sobic004G131300 Sobic002G133300 Sobic002G133300 Sobic001G251100--Sobic002G133300 Sobic003G293300 Sobic003G293300 Sobic001G251100--Sobic003G293300 Sobic001G251100--Sobic007G054800 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic001G251100--Sobic001G493700 Sobic001G251100--Sobic004G257100 Sobic003G379200 Sobic003G379200 Sobic001G251100--Sobic003G379200 Sobic001G117800 Sobic001G117800 Sobic003G029600--Sobic001G117800 Sobic003G029600--Sobic003G314700 Sobic002G070600 Sobic002G070600 Sobic003G029600--Sobic002G070600 Sobic002G340900 Sobic002G340900 Sobic003G029600--Sobic002G340900 Sobic001G301200 Sobic001G301200 Sobic003G029600--Sobic001G301200 Sobic003G029600--Sobic001G449900 Sobic008G124800 Sobic008G124800 Sobic003G029600--Sobic008G124800 Sobic009G118900 Sobic009G118900 Sobic003G029600--Sobic009G118900 Sobic001G437400 Sobic001G437400 Sobic003G029600--Sobic001G437400 Sobic008G033500--Sobic010G020400 Sobic001G014800 Sobic001G014800 Sobic008G033500--Sobic001G014800 Sobic008G033500--Sobic001G333100 Sobic008G033500--Sobic002G020700 Sobic008G033500--Sobic007G162100 Sobic008G033500--Sobic006G127600 Sobic003G422900 Sobic003G422900 Sobic008G033500--Sobic003G422900 Sobic009G068500 Sobic009G068500 Sobic008G033500--Sobic009G068500 Sobic001G193300 Sobic001G193300 Sobic008G033500--Sobic001G193300 Sobic003G221400 Sobic003G221400 Sobic007G054800--Sobic003G221400 Sobic001G110600 Sobic001G110600 Sobic007G054800--Sobic001G110600 Sobic001G004400 Sobic001G004400 Sobic007G054800--Sobic001G004400 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic007G054800--Sobic005G162500 Sobic007G054800--Sobic006G280000 Sobic007G054800--Sobic002G256700 Sobic007G054800--Sobic002G133300 Sobic002G142900 Sobic002G142900 Sobic007G054800--Sobic002G142900 Sobic007G054800--Sobic004G131300
Octagon: transcription factors


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