Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G086300.1
Synonym Sb09g007980
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YV71
Pfam -
Panther DB PTHR34397 PTHR34397:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g14360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G153000 expressed protein -
2 Sobic.004G313500 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
3 Sobic.003G066700 OsFBX164 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G289000 expressed protein -
5 Sobic.001G186600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed -
6 Sobic.006G262700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G344301 - -
8 Sobic.002G400300 expressed protein -
9 Sobic.004G141600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@vegetative storage protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G095200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
11 Sobic.002G059800 - -
12 Sobic.004G332600 OsFBL15 - F-box domain and LRR containing protein, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
13 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
14 Sobic.005G125000 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
15 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G106000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G088200 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.004G346200 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
19 Sobic.001G186850 - -
20 Sobic.008G041000 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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