Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G092300.1
Synonym Sb09g010410
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YVP4
Pfam PF04788
Panther DB PTHR31300 PTHR31300:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G05840 : Protein of unknown function (DUF620)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g16300.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043225
Brachypodium KQK06958
Barley -
Wheat TraesCS1A02G133000 , TraesCS1B02G151200 , TraesCS1D02G131900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G180550 - -
2 Sobic.007G126150 - -
3 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
4 Sobic.009G143750 - -
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6 Sobic.004G210400 expressed protein -
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9 Sobic.001G075500 - -
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11 Sobic.002G270733 - -
12 Sobic.002G138400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
13 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
14 Sobic.006G016950 - -
15 Sobic.005G002050 - -
16 Sobic.006G124800 - -
17 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
18 Sobic.003G172600 - -
19 Sobic.004G107550 - -
20 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein


Gene co-expression network
sample Sobic009G092300 Sobic009G092300 Sobic010G180550 Sobic010G180550 Sobic009G092300--Sobic010G180550 Sobic007G126150 Sobic007G126150 Sobic009G092300--Sobic007G126150 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic009G092300--Sobic001G487900 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic009G092300--Sobic009G143750 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic009G092300--Sobic007G207100 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic009G092300--Sobic004G210400 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic009G092300--Sobic003G369566 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic009G092300--Sobic002G150200 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic009G092300--Sobic001G075500 Sobic010G180550--Sobic003G369566 Sobic010G180550--Sobic009G092300 Sobic002G311900 Sobic002G311900 Sobic010G180550--Sobic002G311900 Sobic005G096450 Sobic005G096450 Sobic010G180550--Sobic005G096450 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic010G180550--Sobic007G149200 Sobic001G519700 Sobic001G519700 Sobic010G180550--Sobic001G519700 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic010G180550--Sobic003G169000 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic010G180550--Sobic001G011600 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic010G180550--Sobic006G258600 Sobic007G126150--Sobic009G143750 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic007G126150--Sobic007G108600 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic007G126150--Sobic007G183200 Sobic007G126150--Sobic007G207100 Sobic007G126150--Sobic009G092300 Sobic007G126150--Sobic001G487900 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic007G126150--Sobic006G016950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G126150--Sobic006G097600 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic007G126150--Sobic003G172300 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G487900--Sobic003G169100 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic001G487900--Sobic010G139200 Sobic009G143750--Sobic001G487900 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic009G143750--Sobic001G502801 Sobic009G143750--Sobic007G183200 Sobic009G143750--Sobic003G172600 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic009G143750--Sobic002G358450 Sobic009G143750--Sobic006G124800 Sobic009G143750--Sobic007G207100 Sobic009G143750--Sobic006G016950 Sobic009G143750--Sobic007G126150 Sobic007G207100--Sobic002G150200 Sobic007G207100--Sobic004G210400 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G130200 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic007G207100--Sobic003G117850 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic007G207100--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic007G207100--Sobic005G002050 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic003G172600 Sobic007G207100--Sobic001G487900 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic005G002050 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic003G369566--Sobic003G369533 Sobic003G369566--Sobic007G149200 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G369566--Sobic003G168200 Sobic003G369566--Sobic002G311900 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic003G369566--Sobic005G116400 Sobic003G369566--Sobic003G169100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G369566--Sobic003G352000 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G369566--SobicK029400 Sobic003G369566--Sobic003G169000 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic001G075500--Sobic006G124800 Sobic001G075500--Sobic001G487900 Sobic001G075500--SobicK032300 Sobic001G075500--Sobic004G210400 Sobic001G075500--Sobic010G139200 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic001G075500--Sobic001G182700 Sobic001G075500--Sobic002G150200 Sobic001G075500--Sobic003G130200 Sobic001G075500--Sobic004G087050
Octagon: transcription factors


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