Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G098300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7K3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G080550 - -
2 Sobic.001G245000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G146600 pumilio-family RNA binding repeat containing protein, expressed K14790: nucleolar protein 9
4 Sobic.003G159200 poly synthetase 2-A, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
5 Sobic.006G216200 expressed protein -
6 Sobic.001G532400 inner membrane protein, putative, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase
7 Sobic.009G090500 transcription factor jumonji, putative, expressed K11446: KDM5, [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
8 Sobic.001G332700 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
9 Sobic.008G088872 - -
10 Sobic.009G254100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12818: DHX8, ATP-dependent RNA helicase DHX8/PRP22
11 Sobic.004G265500 SET domain protein SDG117, putative, expressed -
12 Sobic.003G012000 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G149700 SEY1, putative, expressed -
14 Sobic.002G241600 - -
15 Sobic.010G254900 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed K14321: NUPL2, NUP42, nucleoporin-like protein 2
16 Sobic.006G178100 coiled-coil domain-containing protein 139, putative, expressed K07583: tRNA pseudouridine synthase 10
17 Sobic.002G235200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G108000 - -
19 Sobic.004G319900 expressed protein K05310: PIGG, ethanolamine phosphate transferase 2 subunit G
20 Sobic.001G376200 auxin response factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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