Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G080550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRX4 , C6JSP5
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Panther DB -
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G098300 - -
2 Sobic.002G127200 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G014300 OsFBDUF15 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G108000 - -
5 Sobic.004G149700 SEY1, putative, expressed -
6 Sobic.006G216200 expressed protein -
7 Sobic.004G223300 ARF GTPase-activating domain-containing protein, putative, expressed K12489: Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein
8 Sobic.001G245000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G154100 mRNA cap guanine-N7 methyltransferase 2, putative, expressed K00565: mRNA (guanine-N7-)-methyltransferase
10 Sobic.002G422100 EMB1011, putative, expressed K14317: NUP214, nuclear pore complex protein Nup214
11 Sobic.004G265500 SET domain protein SDG117, putative, expressed -
12 Sobic.002G042600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative, expressed K11838: USP7, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
13 Sobic.007G155500 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G542450 - -
15 Sobic.004G147500 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K09667: protein O-GlcNAc transferase
16 Sobic.005G024400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G254900 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed K14321: NUPL2, NUP42, nucleoporin-like protein 2
18 Sobic.002G405500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11841: USP10, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10
19 Sobic.006G080400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11851: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
20 Sobic.002G235200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G080550 Sobic010G080550 Sobic009G098300 Sobic009G098300 Sobic010G080550--Sobic009G098300 Sobic002G127200 Sobic002G127200 Sobic010G080550--Sobic002G127200 Sobic001G014300 Sobic001G014300 Sobic010G080550--Sobic001G014300 Sobic005G108000 Sobic005G108000 Sobic010G080550--Sobic005G108000 Sobic004G149700 Sobic004G149700 Sobic010G080550--Sobic004G149700 Sobic006G216200 Sobic006G216200 Sobic010G080550--Sobic006G216200 Sobic004G223300 Sobic004G223300 Sobic010G080550--Sobic004G223300 Sobic001G245000 Sobic001G245000 Sobic010G080550--Sobic001G245000 Sobic006G154100 Sobic006G154100 Sobic010G080550--Sobic006G154100 Sobic009G098300--Sobic010G080550 Sobic009G098300--Sobic001G245000 Sobic003G146600 Sobic003G146600 Sobic009G098300--Sobic003G146600 Sobic003G159200 Sobic003G159200 Sobic009G098300--Sobic003G159200 Sobic009G098300--Sobic006G216200 Sobic001G532400 Sobic001G532400 Sobic009G098300--Sobic001G532400 Sobic009G090500 Sobic009G090500 Sobic009G098300--Sobic009G090500 Sobic001G332700 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Octagon: transcription factors


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