Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G103300.1
Synonym Sb09g016500
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R2W9
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF118
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G40250 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g28470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037668
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G003800 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G115950 - -
3 Sobic.005G030600 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, putative, expressed K03013: RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
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5 Sobic.010G118900 fasciclin-like arabinogalactan protein 8 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.006G097300 F-box protein FBW2, putative, expressed -
7 Sobic.007G150500 expressed protein -
8 Sobic.001G015700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.001G171200 expressed protein -
10 Sobic.008G026400 expressed protein -
11 Sobic.002G238900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G171100 expressed protein -
13 Sobic.001G377600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
14 Sobic.004G035800 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G027200 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G345800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G164800 pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G072900 OsMADS13 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
19 Sobic.003G443900 - -
20 Sobic.003G381100 OsMADS21 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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